45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2072 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  531  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  94.57 
 
 		 259 aa  454  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  52.74 
 
 		 253 aa  222  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  41.73 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  41.18 
 
 		 235 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  40.39 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  43.26 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  39.27 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  40.91 
 
 		 237 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  32.67 
 
 		 288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  42.34 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  36.62 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  34.41 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  31.31 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  33.47 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  31.9 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  34.92 
 
 		 297 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  27.43 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  39.31 
 
 		 417 aa  96.3  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  32.1 
 
 		 259 aa  95.9  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  33.63 
 
 		 281 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  32.76 
 
 		 264 aa  93.2  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  50.54 
 
 		 138 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  35.71 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  34.91 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  30.65 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  35.62 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  35.62 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  36.31 
 
 		 262 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  31.96 
 
 		 259 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  32.28 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  28.36 
 
 		 965 aa  77  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  31.8 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  33.1 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  31.51 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  32.05 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  31.82 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1951  hypothetical protein  49.06 
 
 		 60 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11261  hypothetical protein  40.74 
 
 		 127 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0470  protein of unknown function DUF1499  33.72 
 
 		 150 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11261  hypothetical protein  40.74 
 
 		 135 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0466258  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1805  hypothetical protein  32.84 
 
 		 152 aa  43.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273509  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1126  hypothetical protein  22.44 
 
 		 299 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2160  hypothetical protein  28.57 
 
 		 164 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.030221  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1038  hypothetical protein  40.74 
 
 		 127 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.56394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>