60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0470 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0470  protein of unknown function DUF1499  100 
 
 
150 aa  306  9e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0435  protein of unknown function DUF1499  60.4 
 
 
151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.332035  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1223  protein of unknown function DUF1499  57.24 
 
 
166 aa  166  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0483  hypothetical protein  55.17 
 
 
148 aa  154  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1824  hypothetical protein  45.83 
 
 
175 aa  108  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123685  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1441  protein of unknown function DUF1499  43.85 
 
 
158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0342472  normal  0.0503993 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0389  protein of unknown function DUF1499  46.21 
 
 
139 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3821  protein of unknown function DUF1499  42.37 
 
 
170 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3871  protein of unknown function DUF1499  42.37 
 
 
170 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2319  hypothetical protein  44.2 
 
 
151 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1318  hypothetical protein  37.24 
 
 
163 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000275052  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2542  hypothetical protein  48.25 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.322137  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0976  hypothetical protein  38.39 
 
 
133 aa  91.3  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1955  hypothetical protein  41.32 
 
 
162 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1554  hypothetical protein  36.36 
 
 
148 aa  87.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000544123 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1798  hypothetical protein  35.66 
 
 
147 aa  84  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.0185679 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1492  protein of unknown function DUF1499  39.17 
 
 
175 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269175 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0429  hypothetical protein  36.43 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2160  hypothetical protein  33.64 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.030221  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3619  hypothetical protein  34.72 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1563  protein of unknown function DUF1499  40.35 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3393  hypothetical protein  29.75 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000893397  normal  0.318269 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1054  protein of unknown function DUF1499  37.93 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00924  hypothetical protein  31.53 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0664  hypothetical protein  31.4 
 
 
168 aa  63.9  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1956  hypothetical protein  34.55 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004470  hypothetical protein  33.03 
 
 
119 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3079  protein of unknown function DUF1499  32.73 
 
 
168 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.13205  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3041  protein of unknown function DUF1499  31.82 
 
 
168 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47157  predicted protein  33.88 
 
 
278 aa  60.1  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1069  hypothetical protein  35.04 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  30.53 
 
 
252 aa  57  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2564  putative lipoprotein  30.84 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0967  hypothetical protein  32.32 
 
 
135 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.25487  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_7768  predicted protein  30.23 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10341  hypothetical protein  30.43 
 
 
132 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14141  hypothetical protein  27.01 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0179828 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02001  hypothetical protein  44.07 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  40.28 
 
 
237 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  30.6 
 
 
249 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11671  hypothetical protein  32.88 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  35.9 
 
 
259 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48250  predicted protein  56.76 
 
 
195 aa  44.3  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  42.86 
 
 
253 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08691  hypothetical protein  48.94 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  35.9 
 
 
262 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0517  hypothetical protein  25.71 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.407544  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07691  hypothetical protein  48.94 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11181  hypothetical protein  30.63 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07711  hypothetical protein  48.94 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.10668  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0714  hypothetical protein  48.94 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.528598  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  31.4 
 
 
238 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12521  hypothetical protein  25.71 
 
 
137 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.603502  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  27.66 
 
 
417 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11261  hypothetical protein  28.83 
 
 
135 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0466258  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  38.57 
 
 
254 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11261  hypothetical protein  28.83 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1038  hypothetical protein  32.43 
 
 
127 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.56394  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  31.52 
 
 
288 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>