58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0976 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0976  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  278  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1798  hypothetical protein  45.24 
 
 
147 aa  121  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.0185679 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1554  hypothetical protein  42.86 
 
 
148 aa  104  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000544123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3871  protein of unknown function DUF1499  48.18 
 
 
170 aa  103  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1318  hypothetical protein  43.59 
 
 
163 aa  104  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000275052  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3821  protein of unknown function DUF1499  48.18 
 
 
170 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0429  hypothetical protein  41.03 
 
 
159 aa  94.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1824  hypothetical protein  41.23 
 
 
175 aa  94  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123685  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3619  hypothetical protein  38.84 
 
 
149 aa  93.6  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0470  protein of unknown function DUF1499  38.39 
 
 
150 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1492  protein of unknown function DUF1499  41.74 
 
 
175 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269175 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0435  protein of unknown function DUF1499  35.77 
 
 
151 aa  87.8  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.332035  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2542  hypothetical protein  37.93 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.322137  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0389  protein of unknown function DUF1499  40 
 
 
139 aa  84.3  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0664  hypothetical protein  36.94 
 
 
168 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2319  hypothetical protein  38.33 
 
 
151 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1563  protein of unknown function DUF1499  38.02 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10341  hypothetical protein  35.4 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3393  hypothetical protein  32.76 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000893397  normal  0.318269 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1956  hypothetical protein  34.65 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1054  protein of unknown function DUF1499  35.65 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02001  hypothetical protein  50 
 
 
108 aa  77  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0483  hypothetical protein  35.25 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1441  protein of unknown function DUF1499  31.86 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0342472  normal  0.0503993 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1223  protein of unknown function DUF1499  37.27 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3079  protein of unknown function DUF1499  38.26 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.13205  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3041  protein of unknown function DUF1499  37.39 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14141  hypothetical protein  32.14 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0179828 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2160  hypothetical protein  34.82 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.030221  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1955  hypothetical protein  31.4 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00924  hypothetical protein  35.14 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004470  hypothetical protein  33.87 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2564  putative lipoprotein  33.9 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11671  hypothetical protein  34.68 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1038  hypothetical protein  29.82 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.56394  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11261  hypothetical protein  36.49 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0466258  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11261  hypothetical protein  35.14 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0517  hypothetical protein  30.97 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.407544  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12521  hypothetical protein  30.97 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.603502  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0967  hypothetical protein  42.67 
 
 
135 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.25487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1069  hypothetical protein  31.62 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07711  hypothetical protein  43.21 
 
 
130 aa  60.1  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.10668  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08691  hypothetical protein  43.21 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0714  hypothetical protein  43.21 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.528598  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11181  hypothetical protein  35.14 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07691  hypothetical protein  43.21 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_7768  predicted protein  30.08 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12241  hypothetical protein  32.46 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0497  hypothetical protein  32.46 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.223469  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48250  predicted protein  34.48 
 
 
195 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47157  predicted protein  24.83 
 
 
278 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44273  predicted protein  28.36 
 
 
260 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1553  hypothetical protein  28.72 
 
 
150 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0118436  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2908  hypothetical protein  28.72 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405207  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38736  predicted protein  31.3 
 
 
361 aa  43.5  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  38.33 
 
 
257 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  41.18 
 
 
417 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0648  hypothetical protein  31.73 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>