54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1798 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1798  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.0185679 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0976  hypothetical protein  44.88 
 
 
133 aa  122  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1318  hypothetical protein  41.23 
 
 
163 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000275052  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00924  hypothetical protein  41.22 
 
 
142 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1492  protein of unknown function DUF1499  41.53 
 
 
175 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269175 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1824  hypothetical protein  37.72 
 
 
175 aa  96.7  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123685  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0429  hypothetical protein  40.35 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3619  hypothetical protein  37.14 
 
 
149 aa  94.4  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2319  hypothetical protein  41.01 
 
 
151 aa  94  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150637  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1554  hypothetical protein  37.69 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000544123 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2564  putative lipoprotein  39.26 
 
 
143 aa  92.8  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3871  protein of unknown function DUF1499  43.52 
 
 
170 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3821  protein of unknown function DUF1499  41.67 
 
 
170 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004470  hypothetical protein  40.52 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0470  protein of unknown function DUF1499  35.34 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0389  protein of unknown function DUF1499  38.03 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0483  hypothetical protein  38.79 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1441  protein of unknown function DUF1499  37.5 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0342472  normal  0.0503993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3393  hypothetical protein  33.62 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000893397  normal  0.318269 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0435  protein of unknown function DUF1499  34.19 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.332035  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1956  hypothetical protein  35.14 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2542  hypothetical protein  34.62 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.322137  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1223  protein of unknown function DUF1499  38.74 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2160  hypothetical protein  37 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.030221  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3079  protein of unknown function DUF1499  31.86 
 
 
168 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.13205  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0664  hypothetical protein  33.08 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3041  protein of unknown function DUF1499  30.97 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1054  protein of unknown function DUF1499  36.11 
 
 
175 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1563  protein of unknown function DUF1499  35.61 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10341  hypothetical protein  30.07 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0967  hypothetical protein  34.55 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.25487  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_7768  predicted protein  33.58 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1955  hypothetical protein  31.67 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02001  hypothetical protein  32.74 
 
 
108 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1069  hypothetical protein  33.04 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14141  hypothetical protein  31.25 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0179828 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0517  hypothetical protein  29.03 
 
 
137 aa  60.1  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.407544  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12521  hypothetical protein  29.03 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.603502  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11671  hypothetical protein  31.15 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12241  hypothetical protein  30.25 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0497  hypothetical protein  30.25 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.223469  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11261  hypothetical protein  26.79 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0466258  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08691  hypothetical protein  39.29 
 
 
117 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11261  hypothetical protein  27.03 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1038  hypothetical protein  27.52 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.56394  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07711  hypothetical protein  41.56 
 
 
130 aa  53.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.10668  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0714  hypothetical protein  41.56 
 
 
117 aa  53.9  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.528598  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07691  hypothetical protein  41.56 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11181  hypothetical protein  32.14 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48250  predicted protein  53.19 
 
 
195 aa  48.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0632  hypothetical protein  31.73 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  31.31 
 
 
257 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47157  predicted protein  25.37 
 
 
278 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0648  hypothetical protein  30.77 
 
 
139 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>