51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1223 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1223  protein of unknown function DUF1499  100 
 
 		 166 aa  343  5e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0435  protein of unknown function DUF1499  59.15 
 
 		 151 aa  187  5e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.332035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0483  hypothetical protein  56.34 
 
 		 148 aa  174  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0470  protein of unknown function DUF1499  57.24 
 
 		 150 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2319  hypothetical protein  48.2 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150637  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1441  protein of unknown function DUF1499  45.87 
 
 		 158 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0342472  normal  0.0503993 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1824  hypothetical protein  44.83 
 
 		 175 aa  107  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123685  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3821  protein of unknown function DUF1499  45.22 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3871  protein of unknown function DUF1499  45.22 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0389  protein of unknown function DUF1499  47.46 
 
 		 139 aa  99.4  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2542  hypothetical protein  48.28 
 
 		 146 aa  95.5  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.322137  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1492  protein of unknown function DUF1499  45.83 
 
 		 175 aa  95.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1318  hypothetical protein  42.02 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1955  hypothetical protein  41.8 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3619  hypothetical protein  43.1 
 
 		 149 aa  86.3  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0429  hypothetical protein  39.02 
 
 		 159 aa  85.1  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1554  hypothetical protein  36.97 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000544123 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1563  protein of unknown function DUF1499  40 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2160  hypothetical protein  37.5 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.030221  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1798  hypothetical protein  38.74 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.0185679 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0976  hypothetical protein  37.27 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1054  protein of unknown function DUF1499  36.97 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3393  hypothetical protein  32.76 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000893397  normal  0.318269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3079  protein of unknown function DUF1499  34.92 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.13205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3041  protein of unknown function DUF1499  34.13 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004470  hypothetical protein  34.86 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1956  hypothetical protein  34.51 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_7768  predicted protein  35.92 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0664  hypothetical protein  34.48 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00924  hypothetical protein  30 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1069  hypothetical protein  33.86 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47157  predicted protein  31.78 
 
 		 278 aa  57.4  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2564  putative lipoprotein  30.97 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02001  hypothetical protein  37.17 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0967  hypothetical protein  42.19 
 
 		 135 aa  52  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.25487  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  32.38 
 
 		 252 aa  50.4  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14141  hypothetical protein  29.91 
 
 		 133 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0179828 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10341  hypothetical protein  28.57 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  47.4  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1038  hypothetical protein  36.51 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.56394  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11261  hypothetical protein  36.51 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0466258  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11261  hypothetical protein  36.51 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48250  predicted protein  34.09 
 
 		 195 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11181  hypothetical protein  40.98 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08691  hypothetical protein  51.06 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07691  hypothetical protein  51.06 
 
 		 117 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07711  hypothetical protein  51.06 
 
 		 130 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.10668  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0714  hypothetical protein  51.06 
 
 		 117 aa  45.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.528598  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11671  hypothetical protein  27.91 
 
 		 119 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  32.61 
 
 		 233 aa  41.2  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  28.95 
 
 		 237 aa  40.8  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.241128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>