55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1955 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1955  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  323  8.000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1824  hypothetical protein  43.17 
 
 		 175 aa  117  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123685  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3821  protein of unknown function DUF1499  37.34 
 
 		 170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3871  protein of unknown function DUF1499  37.34 
 
 		 170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2542  hypothetical protein  42.47 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.322137  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3619  hypothetical protein  37.84 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1492  protein of unknown function DUF1499  40.3 
 
 		 175 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269175 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2319  hypothetical protein  43.42 
 
 		 151 aa  97.1  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150637  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0435  protein of unknown function DUF1499  41.94 
 
 		 151 aa  94.4  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.332035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1554  hypothetical protein  37.21 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000544123 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1318  hypothetical protein  37.75 
 
 		 163 aa  91.3  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3393  hypothetical protein  36.08 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000893397  normal  0.318269 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0470  protein of unknown function DUF1499  41.32 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0483  hypothetical protein  38.52 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1223  protein of unknown function DUF1499  41.8 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0389  protein of unknown function DUF1499  35.51 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1441  protein of unknown function DUF1499  39.56 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0342472  normal  0.0503993 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0429  hypothetical protein  34.92 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1054  protein of unknown function DUF1499  39.81 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0976  hypothetical protein  31.4 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00924  hypothetical protein  31.33 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3041  protein of unknown function DUF1499  37.5 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2564  putative lipoprotein  30.89 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10341  hypothetical protein  37.35 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3079  protein of unknown function DUF1499  36.46 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.13205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1798  hypothetical protein  31.67 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.0185679 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_7768  predicted protein  34.38 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1563  protein of unknown function DUF1499  35.77 
 
 		 142 aa  62  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11261  hypothetical protein  42.19 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11261  hypothetical protein  42.19 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0466258  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1038  hypothetical protein  32.53 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.56394  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12521  hypothetical protein  31.13 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.603502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1069  hypothetical protein  32.19 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004470  hypothetical protein  34.19 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0517  hypothetical protein  31.13 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.407544  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02001  hypothetical protein  32.93 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11181  hypothetical protein  36.25 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14141  hypothetical protein  23.36 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0179828 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0967  hypothetical protein  28.36 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.25487  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1956  hypothetical protein  30.89 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47157  predicted protein  31.82 
 
 		 278 aa  51.6  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12241  hypothetical protein  30.49 
 
 		 110 aa  47.4  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0497  hypothetical protein  30.49 
 
 		 110 aa  47.4  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.223469  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38736  predicted protein  35.79 
 
 		 361 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2160  hypothetical protein  27.88 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.030221  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48250  predicted protein  37.88 
 
 		 195 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0664  hypothetical protein  29.91 
 
 		 168 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11671  hypothetical protein  27.78 
 
 		 119 aa  43.9  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07711  hypothetical protein  28.57 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.10668  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0714  hypothetical protein  29.36 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.528598  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07691  hypothetical protein  29.36 
 
 		 117 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08691  hypothetical protein  28.75 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0632  hypothetical protein  25.93 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  39.68 
 
 		 259 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1153  protein of unknown function DUF1499  44.44 
 
 		 131 aa  40.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>