62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1069 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1069  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  273  4e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0967  hypothetical protein  51.88 
 
 
135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.25487  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1824  hypothetical protein  38.35 
 
 
175 aa  97.8  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123685  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11181  hypothetical protein  35.54 
 
 
127 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1038  hypothetical protein  41.24 
 
 
127 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.56394  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11261  hypothetical protein  39 
 
 
127 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11261  hypothetical protein  39 
 
 
135 aa  87  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0466258  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1492  protein of unknown function DUF1499  36.8 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269175 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3871  protein of unknown function DUF1499  32.81 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3821  protein of unknown function DUF1499  32.81 
 
 
170 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10341  hypothetical protein  37.25 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0517  hypothetical protein  29.46 
 
 
137 aa  77  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.407544  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12521  hypothetical protein  29.46 
 
 
137 aa  76.6  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.603502  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1318  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000275052  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1554  hypothetical protein  39.02 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000544123 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02001  hypothetical protein  35.58 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1441  protein of unknown function DUF1499  42.24 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0342472  normal  0.0503993 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0429  hypothetical protein  33.91 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2319  hypothetical protein  36.5 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150637  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2542  hypothetical protein  33.87 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.322137  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14141  hypothetical protein  29.01 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0179828 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11671  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0435  protein of unknown function DUF1499  35.9 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.332035  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3393  hypothetical protein  25.52 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000893397  normal  0.318269 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0483  hypothetical protein  38.74 
 
 
148 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1798  hypothetical protein  33.04 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.0185679 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0497  hypothetical protein  34.29 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.223469  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12241  hypothetical protein  34.29 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0976  hypothetical protein  31.62 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0470  protein of unknown function DUF1499  35.04 
 
 
150 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3619  hypothetical protein  28.99 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0664  hypothetical protein  31.03 
 
 
168 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0389  protein of unknown function DUF1499  38.74 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1223  protein of unknown function DUF1499  33.86 
 
 
166 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3079  protein of unknown function DUF1499  30.77 
 
 
168 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.13205  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08691  hypothetical protein  38.37 
 
 
117 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3041  protein of unknown function DUF1499  29.91 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1955  hypothetical protein  30.6 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07711  hypothetical protein  38.37 
 
 
130 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.10668  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0714  hypothetical protein  38.37 
 
 
117 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.528598  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07691  hypothetical protein  38.37 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1956  hypothetical protein  43.94 
 
 
144 aa  53.5  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2564  putative lipoprotein  29.85 
 
 
143 aa  53.9  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_7768  predicted protein  39.06 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  35.05 
 
 
237 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00924  hypothetical protein  39.19 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2160  hypothetical protein  32.04 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.030221  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004470  hypothetical protein  47.27 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  40.35 
 
 
238 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  38.24 
 
 
253 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  30.95 
 
 
255 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48250  predicted protein  52.27 
 
 
195 aa  44.3  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  37.93 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  39.68 
 
 
308 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  35.8 
 
 
254 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47157  predicted protein  25.83 
 
 
278 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1054  protein of unknown function DUF1499  31.65 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  40.35 
 
 
263 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  36.99 
 
 
281 aa  40.8  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  38.1 
 
 
297 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  36.84 
 
 
284 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  33.85 
 
 
252 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>