44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0380 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  52.74 
 
 		 262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  50.4 
 
 		 263 aa  216  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  51.26 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  42.79 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  45.37 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  40.34 
 
 		 255 aa  165  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  40.29 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  50.35 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  46.15 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  37.92 
 
 		 233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  34.29 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  42.76 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  36.32 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  36.29 
 
 		 280 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  34.35 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  39 
 
 		 297 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  44.37 
 
 		 417 aa  109  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  42.14 
 
 		 281 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  42.14 
 
 		 317 aa  102  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  30.13 
 
 		 259 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  37.66 
 
 		 264 aa  95.9  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 		 965 aa  95.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  29.24 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  49.02 
 
 		 138 aa  93.2  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  31.84 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  41.67 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  30.23 
 
 		 262 aa  86.3  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  40.69 
 
 		 259 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  40.69 
 
 		 259 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  32.87 
 
 		 247 aa  85.5  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  40.41 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  31.97 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  37.75 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  40.27 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  32.55 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  32.69 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1951  hypothetical protein  50 
 
 		 60 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1126  hypothetical protein  23.81 
 
 		 299 aa  48.5  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2160  hypothetical protein  29.92 
 
 		 164 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.030221  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1069  hypothetical protein  38.24 
 
 		 133 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0470  protein of unknown function DUF1499  36.78 
 
 		 150 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0967  hypothetical protein  35.06 
 
 		 135 aa  42.4  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.25487  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2542  hypothetical protein  42.03 
 
 		 146 aa  42  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.322137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>