47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2228 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  524  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  50.4 
 
 		 253 aa  219  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  41.41 
 
 		 262 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  41.02 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  43.36 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  38.18 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  37.76 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  43.48 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  44.75 
 
 		 237 aa  145  8.000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  40.85 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  38.49 
 
 		 254 aa  128  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  37.39 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  33.61 
 
 		 280 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  34.29 
 
 		 284 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  34.65 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  32.57 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  36.73 
 
 		 297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  39.61 
 
 		 317 aa  108  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  34.29 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  44.23 
 
 		 417 aa  102  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  34.55 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  31.82 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  31.25 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  40 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  34.92 
 
 		 259 aa  92  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  34.81 
 
 		 259 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  35.62 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  34.81 
 
 		 259 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  47.12 
 
 		 138 aa  89.4  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  29.29 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  34.18 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  29.61 
 
 		 965 aa  85.9  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  34.65 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  32.41 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  34.44 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  34.39 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  29.75 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1951  hypothetical protein  52.63 
 
 		 60 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1153  protein of unknown function DUF1499  34.78 
 
 		 131 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2908  hypothetical protein  34.65 
 
 		 147 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405207  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1553  hypothetical protein  33.66 
 
 		 150 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0118436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48250  predicted protein  33.72 
 
 		 195 aa  42.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2160  hypothetical protein  28.57 
 
 		 164 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.030221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1492  protein of unknown function DUF1499  36.9 
 
 		 175 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269175 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1112  hypothetical protein  33.66 
 
 		 150 aa  42.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.0235265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4262  hypothetical protein  27.88 
 
 		 191 aa  42  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1554  hypothetical protein  31.13 
 
 		 148 aa  42  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000544123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>