55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0800 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  491  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  45.16 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  39.04 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  43.05 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  40.97 
 
 		 263 aa  141  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  41.1 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  35.44 
 
 		 235 aa  139  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  37.1 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  35.12 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  33.19 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  33.2 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  36.55 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  32.79 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  32.65 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  32.79 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  40.69 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  32.65 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  32.65 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  32.77 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  31.38 
 
 		 259 aa  105  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  32.91 
 
 		 308 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  42 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  33.17 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  31.12 
 
 		 284 aa  102  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  32.79 
 
 		 259 aa  101  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  52.48 
 
 		 138 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  33.96 
 
 		 297 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  39.86 
 
 		 417 aa  97.1  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  33.16 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  32.26 
 
 		 262 aa  95.1  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  39.58 
 
 		 317 aa  92.8  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  34.65 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  38.46 
 
 		 281 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  28.12 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  31.22 
 
 		 965 aa  77  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  32 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  32.88 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1126  hypothetical protein  26.86 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1951  hypothetical protein  44.64 
 
 		 60 aa  48.9  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0667  hypothetical protein  26.09 
 
 		 301 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634534  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0470  protein of unknown function DUF1499  30.6 
 
 		 150 aa  45.4  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4262  hypothetical protein  27.59 
 
 		 191 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0722  hypothetical protein  39.34 
 
 		 317 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.405276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1824  hypothetical protein  33.75 
 
 		 175 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123685  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1153  protein of unknown function DUF1499  34.83 
 
 		 131 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0551  hypothetical protein  22.58 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11261  hypothetical protein  37.88 
 
 		 135 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0466258  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0389  protein of unknown function DUF1499  35.82 
 
 		 139 aa  43.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11181  hypothetical protein  35.44 
 
 		 127 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0429  hypothetical protein  32.5 
 
 		 159 aa  42.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2160  hypothetical protein  40 
 
 		 164 aa  42  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.030221  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1318  hypothetical protein  30 
 
 		 163 aa  42  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1554  hypothetical protein  30.53 
 
 		 148 aa  42  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000544123 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11261  hypothetical protein  36.36 
 
 		 127 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1038  hypothetical protein  37.88 
 
 		 127 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.56394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>