29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0551 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0551  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  600  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0722  hypothetical protein  49.68 
 
 		 317 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.405276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0667  hypothetical protein  48.21 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634534  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1126  hypothetical protein  46.2 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  30.61 
 
 		 262 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  31.4 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  31.29 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  25 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  26.51 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  27.34 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  26.25 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  28.81 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  27.65 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  25.61 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  25.61 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  26.71 
 
 		 281 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  28.81 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  27.69 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  24.22 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  22.97 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  23.08 
 
 		 238 aa  55.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  26.85 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  26.39 
 
 		 262 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  23.37 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  23 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  25.25 
 
 		 264 aa  44.3  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  36.23 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  43.33 
 
 		 231 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  23.33 
 
 		 233 aa  42.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>