30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1126 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1126  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  585  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0551  hypothetical protein  46.2 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0722  hypothetical protein  47.59 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.405276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0667  hypothetical protein  45.45 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634534  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  31.85 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  33.56 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  26.5 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  27.01 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  27.24 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  25.27 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  28.62 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  25.91 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  25.72 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  26.64 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  28.62 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  28.62 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  26.21 
 
 		 259 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  28.27 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  22.66 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  26.84 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  28.11 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  46.55 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  27.74 
 
 		 317 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  24.74 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  26.18 
 
 		 264 aa  49.7  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  24.04 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  23.41 
 
 		 255 aa  46.2  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  21.1 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  21.81 
 
 		 259 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  23.45 
 
 		 263 aa  42.7  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>