48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1085 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  100 
 
 		 257 aa  499  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  48.66 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  46.96 
 
 		 259 aa  195  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  46.96 
 
 		 259 aa  195  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  46.96 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  47.83 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  46.8 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  46.18 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  40.16 
 
 		 259 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  34.63 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  36.51 
 
 		 288 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  36.05 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  35.83 
 
 		 281 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  33.6 
 
 		 308 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  35.71 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  40.17 
 
 		 317 aa  118  9e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  35.35 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  28.84 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  33.53 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  36.18 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  33.17 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  29.1 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  33.81 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  33.81 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  28.68 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  33.12 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  28.57 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  30 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  35.76 
 
 		 417 aa  72.4  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  27.6 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  32.89 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  36.36 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1126  hypothetical protein  28.19 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  32.4 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  33.55 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 		 965 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0551  hypothetical protein  25.33 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1805  hypothetical protein  50 
 
 		 152 aa  52.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273509  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  25.47 
 
 		 237 aa  52.4  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0667  hypothetical protein  25.59 
 
 		 301 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634534  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0389  protein of unknown function DUF1499  32.81 
 
 		 139 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0722  hypothetical protein  24.41 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.405276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  25.82 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10341  hypothetical protein  35.38 
 
 		 132 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0976  hypothetical protein  38.33 
 
 		 133 aa  42.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1798  hypothetical protein  31.31 
 
 		 147 aa  42  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.0185679 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2160  hypothetical protein  46.3 
 
 		 164 aa  42  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.030221  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07711  hypothetical protein  35.82 
 
 		 130 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.10668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>