34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1805 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1805  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  305  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273509  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1112  hypothetical protein  45.75 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.0235265 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1734  hypothetical protein  40.54 
 
 
154 aa  92  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.368748  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1553  hypothetical protein  43.94 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0118436  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2908  hypothetical protein  43.18 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405207  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0558  hypothetical protein  36.07 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  36.92 
 
 
259 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  42.59 
 
 
297 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  46.43 
 
 
257 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  35.38 
 
 
259 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  44.62 
 
 
280 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0376  hypothetical protein  37.04 
 
 
177 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99591  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  42.59 
 
 
308 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  44.44 
 
 
281 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  33.85 
 
 
259 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  33.85 
 
 
259 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  45.1 
 
 
317 aa  47  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  35.38 
 
 
262 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  37.1 
 
 
264 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  32.31 
 
 
259 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  40 
 
 
288 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  41.18 
 
 
284 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0664  hypothetical protein  45.1 
 
 
168 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  40 
 
 
238 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  32.84 
 
 
262 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  38.6 
 
 
259 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10341  hypothetical protein  45.83 
 
 
132 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2234  hypothetical protein  36.84 
 
 
174 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0580714 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  30.12 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  31.46 
 
 
259 aa  41.2  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  36.11 
 
 
254 aa  41.2  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  40 
 
 
263 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  30.56 
 
 
249 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  34.48 
 
 
261 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>