20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1734 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1734  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.368748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1805  hypothetical protein  40.54 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273509  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1112  hypothetical protein  40.3 
 
 		 150 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.0235265 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1553  hypothetical protein  37.69 
 
 		 150 aa  87.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0118436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2908  hypothetical protein  36.92 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405207  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0558  hypothetical protein  30.33 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  29.67 
 
 		 280 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10341  hypothetical protein  38.46 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  31.75 
 
 		 262 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02001  hypothetical protein  33.71 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12241  hypothetical protein  32.95 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0497  hypothetical protein  32.95 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.223469  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  29.03 
 
 		 297 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  31.34 
 
 		 249 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  30.68 
 
 		 259 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  29.51 
 
 		 259 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  29.51 
 
 		 259 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1824  hypothetical protein  26.88 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123685  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  32.84 
 
 		 253 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>