12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2908 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2908  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  293  4e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405207  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1553  hypothetical protein  98.64 
 
 		 150 aa  291  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0118436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1112  hypothetical protein  85.71 
 
 		 150 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.0235265 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1805  hypothetical protein  40.94 
 
 		 152 aa  94  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273509  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1734  hypothetical protein  34.23 
 
 		 154 aa  89.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.368748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0558  hypothetical protein  32.89 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  34.31 
 
 		 263 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  33.87 
 
 		 238 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  35.78 
 
 		 138 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0976  hypothetical protein  28.72 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1318  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1824  hypothetical protein  27.66 
 
 		 175 aa  41.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123685  normal  0.565868 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>