49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1677 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  100 
 
 		 138 aa  278  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  52.48 
 
 		 249 aa  100  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  53.76 
 
 		 259 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  47.12 
 
 		 263 aa  89  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  50.54 
 
 		 262 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  43.16 
 
 		 252 aa  87  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  40.54 
 
 		 238 aa  83.6  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  49.02 
 
 		 253 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  40.19 
 
 		 233 aa  80.9  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  44.12 
 
 		 417 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  41 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  37.37 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  38.38 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  38.38 
 
 		 237 aa  72  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  40.2 
 
 		 259 aa  70.9  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  41.35 
 
 		 264 aa  70.5  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  33.94 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  42.31 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  35.71 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  35.71 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  35.71 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  37.86 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  35.71 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  37.08 
 
 		 965 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  34.29 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  35.24 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  36.27 
 
 		 308 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  37 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  35.71 
 
 		 317 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  35.92 
 
 		 262 aa  58.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  29.77 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  31.96 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  34.74 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  35.71 
 
 		 284 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  40.43 
 
 		 261 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  32.04 
 
 		 262 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  30.61 
 
 		 247 aa  47.8  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1951  hypothetical protein  50.94 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4262  hypothetical protein  27.27 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1318  hypothetical protein  34.72 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1112  hypothetical protein  35.35 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.0235265 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1069  hypothetical protein  37.93 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2908  hypothetical protein  36.7 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405207  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1553  hypothetical protein  35.78 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0118436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1554  hypothetical protein  35.59 
 
 		 148 aa  41.2  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000544123 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12241  hypothetical protein  36.67 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1805  hypothetical protein  30.12 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273509  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0497  hypothetical protein  36.67 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.223469  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48250  predicted protein  30.7 
 
 		 195 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>