48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1445 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  40.34 
 
 		 253 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  36.55 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  38.81 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  39.27 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  37.84 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  36.24 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  35.68 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  35.71 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  46.48 
 
 		 252 aa  122  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  34.93 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  34.96 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  42.47 
 
 		 417 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  36.71 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  35.2 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  37.5 
 
 		 280 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  31.54 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  40.61 
 
 		 284 aa  99.8  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  36.04 
 
 		 297 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  36.04 
 
 		 308 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  37.31 
 
 		 281 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  34.47 
 
 		 259 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  35.44 
 
 		 259 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  35.44 
 
 		 259 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  40.94 
 
 		 317 aa  95.5  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  37.79 
 
 		 264 aa  93.2  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  35.06 
 
 		 259 aa  92  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  37.27 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  34.9 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  36.3 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  34.59 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  31.41 
 
 		 965 aa  80.1  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  41 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  32.11 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  31.91 
 
 		 247 aa  71.6  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  31.03 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  34.21 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1951  hypothetical protein  47.37 
 
 		 60 aa  57  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0470  protein of unknown function DUF1499  33.33 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0435  protein of unknown function DUF1499  30.53 
 
 		 151 aa  52  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.332035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1223  protein of unknown function DUF1499  33.33 
 
 		 166 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1824  hypothetical protein  30.93 
 
 		 175 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123685  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2160  hypothetical protein  28.03 
 
 		 164 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.030221  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1069  hypothetical protein  30.95 
 
 		 133 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1126  hypothetical protein  22.77 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0722  hypothetical protein  34.43 
 
 		 317 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.405276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0667  hypothetical protein  36.07 
 
 		 301 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634534  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2542  hypothetical protein  35.44 
 
 		 146 aa  42  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.322137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>