37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0858 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  520  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  31.54 
 
 
255 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  32.66 
 
 
233 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  33.16 
 
 
249 aa  95.9  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  28.57 
 
 
254 aa  89.4  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  29.29 
 
 
263 aa  85.9  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  26.78 
 
 
262 aa  85.5  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  27.04 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  33.55 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  28.57 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  29.24 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  32.12 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  35.95 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  30.9 
 
 
965 aa  77  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  32.14 
 
 
238 aa  72  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  32.07 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  35.06 
 
 
288 aa  69.7  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  31.85 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  35.62 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  34.53 
 
 
417 aa  67.4  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  35.42 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  29.25 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  31.41 
 
 
259 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  33.56 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  31.4 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  33.56 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  31.94 
 
 
284 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  33.56 
 
 
259 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  27.63 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  29.49 
 
 
259 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  31.02 
 
 
308 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  31.96 
 
 
138 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  30.77 
 
 
281 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  28.76 
 
 
262 aa  53.9  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  27.56 
 
 
262 aa  52  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  33.81 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  26.87 
 
 
231 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.747945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>