46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2148 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  522  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  94.57 
 
 		 262 aa  472  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  52.7 
 
 		 253 aa  224  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  41.34 
 
 		 263 aa  178  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  43.72 
 
 		 249 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  37.72 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  38.81 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  38.92 
 
 		 238 aa  143  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  39.77 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  37.38 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  43.8 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  33.47 
 
 		 288 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  31.31 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  34.58 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  33.47 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  40 
 
 		 417 aa  101  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  30.77 
 
 		 284 aa  99  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  34.39 
 
 		 297 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  53.76 
 
 		 138 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  32.76 
 
 		 264 aa  95.9  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  27.47 
 
 		 263 aa  95.9  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  31.67 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  33.04 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  33.76 
 
 		 259 aa  89  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  33.76 
 
 		 259 aa  89  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  30.66 
 
 		 247 aa  88.6  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  30.65 
 
 		 259 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  31.96 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  35.67 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  32.7 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  28.02 
 
 		 965 aa  76.3  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  31.79 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  32.41 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  32.21 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  32.65 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  32.41 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1951  hypothetical protein  50.94 
 
 		 60 aa  57  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1126  hypothetical protein  22.83 
 
 		 299 aa  46.2  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0470  protein of unknown function DUF1499  35.9 
 
 		 150 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12521  hypothetical protein  31.25 
 
 		 137 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.603502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11261  hypothetical protein  40.74 
 
 		 127 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11261  hypothetical protein  40.74 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0466258  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1038  hypothetical protein  40.74 
 
 		 127 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.56394  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0517  hypothetical protein  34.78 
 
 		 137 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.407544  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11181  hypothetical protein  37.84 
 
 		 127 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>