43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2472 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  511  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  42.97 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  43.78 
 
 
288 aa  198  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  41.3 
 
 
280 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  45.34 
 
 
317 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  40.74 
 
 
308 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  40.08 
 
 
297 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  38.06 
 
 
281 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  39.84 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  37.85 
 
 
259 aa  142  7e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  37.85 
 
 
259 aa  142  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  37.45 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  39.84 
 
 
259 aa  139  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  41.73 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  35.36 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  38.74 
 
 
257 aa  118  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  30.43 
 
 
235 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  36.51 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  38.1 
 
 
263 aa  99.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  35.14 
 
 
254 aa  96.3  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  31.38 
 
 
249 aa  95.5  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  34 
 
 
252 aa  95.1  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  32.1 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  30.68 
 
 
238 aa  89.7  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  32.28 
 
 
262 aa  89  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  30.13 
 
 
253 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  34.9 
 
 
255 aa  88.2  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  31.65 
 
 
259 aa  86.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  25.82 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  28.95 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  35.95 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  32.9 
 
 
417 aa  76.3  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 
965 aa  75.5  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  29.02 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  40.2 
 
 
138 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  31.39 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0551  hypothetical protein  27.05 
 
 
302 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  31.87 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1126  hypothetical protein  26.84 
 
 
299 aa  46.6  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0722  hypothetical protein  45.1 
 
 
317 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.405276  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0667  hypothetical protein  40.68 
 
 
301 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634534  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1441  protein of unknown function DUF1499  32.81 
 
 
158 aa  43.9  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0342472  normal  0.0503993 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1805  hypothetical protein  38.6 
 
 
152 aa  42.4  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273509  normal  0.191083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>