56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1441 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1441  protein of unknown function DUF1499  100 
 
 
158 aa  324  3e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0342472  normal  0.0503993 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0483  hypothetical protein  47.41 
 
 
148 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0470  protein of unknown function DUF1499  43.75 
 
 
150 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1223  protein of unknown function DUF1499  45.87 
 
 
166 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0435  protein of unknown function DUF1499  45.28 
 
 
151 aa  105  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.332035  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2542  hypothetical protein  45.9 
 
 
146 aa  97.8  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.322137  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1824  hypothetical protein  35.77 
 
 
175 aa  97.1  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123685  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2319  hypothetical protein  38.93 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1318  hypothetical protein  40.35 
 
 
163 aa  94.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000275052  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0389  protein of unknown function DUF1499  42.22 
 
 
139 aa  91.7  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2160  hypothetical protein  37.5 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.030221  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3619  hypothetical protein  38.52 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1492  protein of unknown function DUF1499  40.34 
 
 
175 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269175 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3871  protein of unknown function DUF1499  30.46 
 
 
170 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3821  protein of unknown function DUF1499  30.46 
 
 
170 aa  84  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1554  hypothetical protein  37.19 
 
 
148 aa  83.6  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000544123 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1798  hypothetical protein  37.5 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.0185679 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0429  hypothetical protein  35.09 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3393  hypothetical protein  31.76 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000893397  normal  0.318269 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1069  hypothetical protein  40 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0976  hypothetical protein  31.86 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0664  hypothetical protein  36.84 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1955  hypothetical protein  37.19 
 
 
162 aa  73.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1956  hypothetical protein  37.84 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004470  hypothetical protein  40.18 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2564  putative lipoprotein  37.5 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10341  hypothetical protein  55.93 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00924  hypothetical protein  35.78 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1563  protein of unknown function DUF1499  36.69 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3079  protein of unknown function DUF1499  30.17 
 
 
168 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.13205  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1054  protein of unknown function DUF1499  34.55 
 
 
175 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3041  protein of unknown function DUF1499  29.31 
 
 
168 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02001  hypothetical protein  41.56 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47157  predicted protein  34.35 
 
 
278 aa  59.7  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0967  hypothetical protein  47.46 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.25487  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14141  hypothetical protein  25.9 
 
 
133 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0179828 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0497  hypothetical protein  32.74 
 
 
110 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.223469  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12241  hypothetical protein  32.74 
 
 
110 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11181  hypothetical protein  41.77 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1038  hypothetical protein  34.57 
 
 
127 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.56394  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08691  hypothetical protein  47.17 
 
 
117 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11261  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11671  hypothetical protein  41.67 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11261  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0466258  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07691  hypothetical protein  47.17 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07711  hypothetical protein  47.17 
 
 
130 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.10668  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0714  hypothetical protein  40.91 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.528598  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  40.3 
 
 
254 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12521  hypothetical protein  30.77 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.603502  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_7768  predicted protein  27.48 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0517  hypothetical protein  30.77 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.407544  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  26.32 
 
 
252 aa  44.3  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  32.81 
 
 
259 aa  44.3  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48250  predicted protein  32.46 
 
 
195 aa  44.3  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  33.68 
 
 
317 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  43.14 
 
 
249 aa  41.6  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>