54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2319 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2319  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  303  5.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1563  protein of unknown function DUF1499  58.93 
 
 		 142 aa  122  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1492  protein of unknown function DUF1499  50 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269175 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1824  hypothetical protein  46.97 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123685  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3821  protein of unknown function DUF1499  45.24 
 
 		 170 aa  120  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3871  protein of unknown function DUF1499  44.44 
 
 		 170 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1318  hypothetical protein  43.23 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3619  hypothetical protein  46.62 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1223  protein of unknown function DUF1499  48.2 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0435  protein of unknown function DUF1499  46.56 
 
 		 151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.332035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1554  hypothetical protein  43.31 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000544123 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0470  protein of unknown function DUF1499  44.2 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2542  hypothetical protein  41.73 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.322137  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0429  hypothetical protein  41.26 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3393  hypothetical protein  36.43 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000893397  normal  0.318269 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0483  hypothetical protein  42.07 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1955  hypothetical protein  45.45 
 
 		 162 aa  94.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1798  hypothetical protein  42.74 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.0185679 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1441  protein of unknown function DUF1499  40.65 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0342472  normal  0.0503993 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0976  hypothetical protein  38.33 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0389  protein of unknown function DUF1499  44.54 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1054  protein of unknown function DUF1499  38.28 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004470  hypothetical protein  40.17 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1956  hypothetical protein  33.9 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3079  protein of unknown function DUF1499  32.68 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.13205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3041  protein of unknown function DUF1499  32.68 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1069  hypothetical protein  36.5 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00924  hypothetical protein  35.21 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2160  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.030221  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_7768  predicted protein  33.09 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0664  hypothetical protein  34.56 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2564  putative lipoprotein  29.17 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10341  hypothetical protein  30.08 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0967  hypothetical protein  31.15 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.25487  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02001  hypothetical protein  32.43 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47157  predicted protein  32 
 
 		 278 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11671  hypothetical protein  28.33 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14141  hypothetical protein  26.42 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0179828 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11261  hypothetical protein  26.61 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0466258  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0714  hypothetical protein  37.35 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.528598  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11261  hypothetical protein  27.36 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07691  hypothetical protein  37.35 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1038  hypothetical protein  27.36 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.56394  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07711  hypothetical protein  37.35 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.10668  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08691  hypothetical protein  36.14 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38736  predicted protein  28.57 
 
 		 361 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12521  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.603502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0517  hypothetical protein  24.26 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.407544  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0648  hypothetical protein  29.17 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12241  hypothetical protein  29.31 
 
 		 110 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0497  hypothetical protein  29.31 
 
 		 110 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.223469  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44273  predicted protein  29.17 
 
 		 260 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  31.78 
 
 		 252 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0632  hypothetical protein  27.86 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>