60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2160 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2160  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  338  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.030221  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1441  protein of unknown function DUF1499  37.5 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0342472  normal  0.0503993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1318  hypothetical protein  38.81 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000275052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1054  protein of unknown function DUF1499  36.97 
 
 		 175 aa  85.5  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0664  hypothetical protein  35 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3871  protein of unknown function DUF1499  33.09 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3821  protein of unknown function DUF1499  36.89 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0435  protein of unknown function DUF1499  34.23 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.332035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1223  protein of unknown function DUF1499  37.5 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0470  protein of unknown function DUF1499  32.79 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2542  hypothetical protein  35.25 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.322137  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1824  hypothetical protein  35.51 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123685  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0389  protein of unknown function DUF1499  40 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1798  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.0185679 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0429  hypothetical protein  37.86 
 
 		 159 aa  72  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0976  hypothetical protein  34.51 
 
 		 133 aa  72  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3619  hypothetical protein  33.59 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0483  hypothetical protein  34 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00924  hypothetical protein  34.29 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1492  protein of unknown function DUF1499  36.89 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269175 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2564  putative lipoprotein  34.4 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1563  protein of unknown function DUF1499  32.82 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1554  hypothetical protein  36 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000544123 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2319  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  67  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150637  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1956  hypothetical protein  39.22 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3393  hypothetical protein  35.19 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000893397  normal  0.318269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3079  protein of unknown function DUF1499  33.64 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.13205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004470  hypothetical protein  36.63 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3041  protein of unknown function DUF1499  32.71 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14141  hypothetical protein  25.95 
 
 		 133 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0179828 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02001  hypothetical protein  39.44 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0517  hypothetical protein  32.38 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.407544  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10341  hypothetical protein  33.01 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12521  hypothetical protein  32.38 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.603502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11671  hypothetical protein  28.12 
 
 		 119 aa  51.6  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_7768  predicted protein  28.23 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  28.03 
 
 		 255 aa  47.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07711  hypothetical protein  34.55 
 
 		 130 aa  47.4  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.10668  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  32.65 
 
 		 252 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0714  hypothetical protein  40.98 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.528598  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1069  hypothetical protein  32.04 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08691  hypothetical protein  44.64 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07691  hypothetical protein  44.64 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1955  hypothetical protein  27.88 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0967  hypothetical protein  34.72 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.25487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  29.32 
 
 		 253 aa  45.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  27.42 
 
 		 237 aa  44.3  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0648  hypothetical protein  32.35 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  28.57 
 
 		 262 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  32.67 
 
 		 233 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  27.63 
 
 		 263 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  46.3 
 
 		 257 aa  42.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  28.35 
 
 		 238 aa  42  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  30.71 
 
 		 417 aa  42  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  40 
 
 		 249 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  38.1 
 
 		 254 aa  42  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0632  hypothetical protein  32.35 
 
 		 139 aa  40.8  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47157  predicted protein  27.64 
 
 		 278 aa  40.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  27.41 
 
 		 138 aa  40.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  31.96 
 
 		 259 aa  40.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>