50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_02001 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_02001  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  219  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10341  hypothetical protein  60.19 
 
 
132 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11671  hypothetical protein  60.87 
 
 
119 aa  143  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0497  hypothetical protein  53.7 
 
 
110 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.223469  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12241  hypothetical protein  53.7 
 
 
110 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08691  hypothetical protein  51.3 
 
 
117 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0714  hypothetical protein  51.3 
 
 
117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.528598  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07711  hypothetical protein  53.47 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.10668  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07691  hypothetical protein  52.34 
 
 
117 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0517  hypothetical protein  40 
 
 
137 aa  88.2  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.407544  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14141  hypothetical protein  37.04 
 
 
133 aa  87.4  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0179828 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12521  hypothetical protein  40 
 
 
137 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.603502  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0967  hypothetical protein  38.61 
 
 
135 aa  77  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.25487  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0976  hypothetical protein  50 
 
 
133 aa  77  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11261  hypothetical protein  36 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0466258  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11261  hypothetical protein  36 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1318  hypothetical protein  37.27 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000275052  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1069  hypothetical protein  35.58 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1554  hypothetical protein  34.75 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000544123 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1038  hypothetical protein  34 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.56394  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2542  hypothetical protein  35.96 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.322137  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11181  hypothetical protein  36 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0429  hypothetical protein  34.23 
 
 
159 aa  67  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1824  hypothetical protein  36.52 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123685  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1798  hypothetical protein  32.74 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.0185679 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1492  protein of unknown function DUF1499  36.61 
 
 
175 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269175 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1441  protein of unknown function DUF1499  41.56 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0342472  normal  0.0503993 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1955  hypothetical protein  32.93 
 
 
162 aa  58.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0664  hypothetical protein  37.84 
 
 
168 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1223  protein of unknown function DUF1499  37.17 
 
 
166 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2160  hypothetical protein  39.44 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.030221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2319  hypothetical protein  32.43 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150637  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3871  protein of unknown function DUF1499  37.5 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1956  hypothetical protein  35.71 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3079  protein of unknown function DUF1499  32.74 
 
 
168 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.13205  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00924  hypothetical protein  37.5 
 
 
142 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2564  putative lipoprotein  45.83 
 
 
143 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3821  protein of unknown function DUF1499  36.25 
 
 
170 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3041  protein of unknown function DUF1499  31.86 
 
 
168 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004470  hypothetical protein  34.82 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0389  protein of unknown function DUF1499  37.96 
 
 
139 aa  50.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0470  protein of unknown function DUF1499  44.07 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3393  hypothetical protein  27.59 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000893397  normal  0.318269 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3619  hypothetical protein  30.43 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0483  hypothetical protein  44.64 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1054  protein of unknown function DUF1499  37.5 
 
 
175 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0435  protein of unknown function DUF1499  31.3 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.332035  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1734  hypothetical protein  33.71 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.368748  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_7768  predicted protein  44.44 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  29.76 
 
 
252 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>