45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3697 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  508  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  36.97 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  37.04 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  46.48 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  34.55 
 
 		 259 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  37.07 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  39.64 
 
 		 249 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  33.05 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  32.8 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  36.99 
 
 		 235 aa  105  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  36.81 
 
 		 238 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  38.1 
 
 		 317 aa  101  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  34.71 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  37.43 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  35.36 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  35.57 
 
 		 297 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  32.26 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  39.19 
 
 		 417 aa  95.1  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  35.05 
 
 		 308 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  37.21 
 
 		 284 aa  93.2  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  36.81 
 
 		 281 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  43.16 
 
 		 138 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  31.36 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  35.58 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  35.58 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 		 965 aa  78.6  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  34.73 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  31.47 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  32.45 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  29.79 
 
 		 262 aa  72  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  31.97 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  26.57 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  28.37 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  28.96 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  29.79 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  32.47 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  27.17 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0470  protein of unknown function DUF1499  30.53 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1223  protein of unknown function DUF1499  32.38 
 
 		 166 aa  50.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1554  hypothetical protein  28.12 
 
 		 148 aa  48.9  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000544123 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12521  hypothetical protein  28.24 
 
 		 137 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.603502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2160  hypothetical protein  32.65 
 
 		 164 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.030221  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0517  hypothetical protein  28.24 
 
 		 137 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.407544  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1441  protein of unknown function DUF1499  26.04 
 
 		 158 aa  44.3  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0342472  normal  0.0503993 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14141  hypothetical protein  32.93 
 
 		 133 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0179828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>