43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2453 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  68.89 
 
 		 280 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  62.82 
 
 		 284 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  64.56 
 
 		 308 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  64.56 
 
 		 297 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  65.16 
 
 		 281 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  62.69 
 
 		 317 aa  281  8.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  43.78 
 
 		 259 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  37.5 
 
 		 259 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  37.2 
 
 		 259 aa  145  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  37.2 
 
 		 259 aa  145  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  36.8 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  37.5 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  33.08 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  35.08 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  34.89 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  35.91 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  30.54 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  30.21 
 
 		 237 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  32.67 
 
 		 262 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  34.65 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  42.76 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  31.8 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  36.71 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  35.23 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  32.53 
 
 		 262 aa  96.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  33.02 
 
 		 233 aa  96.3  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  37.65 
 
 		 252 aa  95.5  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  36.16 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  32.95 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  38.51 
 
 		 417 aa  87.4  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  27.69 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1126  hypothetical protein  26.5 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  32.89 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  35.06 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  42.31 
 
 		 138 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  31.42 
 
 		 231 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  30.5 
 
 		 965 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0551  hypothetical protein  26.25 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0722  hypothetical protein  26.71 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.405276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0667  hypothetical protein  25.08 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634534  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1805  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273509  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1951  hypothetical protein  39.62 
 
 		 60 aa  44.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>