44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0614 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  635    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  83.1 
 
 
284 aa  483  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  67.14 
 
 
280 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  60.21 
 
 
288 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  63.21 
 
 
308 aa  348  9e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  64.29 
 
 
297 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  63.03 
 
 
281 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  45.34 
 
 
259 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  39.27 
 
 
259 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  39.27 
 
 
259 aa  153  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  39.27 
 
 
259 aa  153  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  37.96 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  37.96 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  40.49 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  33.33 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  35.48 
 
 
235 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  38.2 
 
 
257 aa  122  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  33.88 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  35.94 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  34.96 
 
 
253 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  30.65 
 
 
237 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  37.33 
 
 
252 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  38.42 
 
 
255 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  31.3 
 
 
261 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  33.71 
 
 
238 aa  94.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  31.86 
 
 
254 aa  91.3  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  31.88 
 
 
233 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  33.17 
 
 
262 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  33.5 
 
 
259 aa  87  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  32.5 
 
 
417 aa  82.8  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  30.04 
 
 
262 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  27.59 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0551  hypothetical protein  27.3 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1126  hypothetical protein  28.88 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  32.63 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0722  hypothetical protein  28.28 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.405276  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0667  hypothetical protein  27.08 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634534  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  31.98 
 
 
231 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  30.26 
 
 
247 aa  59.7  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  35.71 
 
 
138 aa  59.3  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  25.51 
 
 
965 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1805  hypothetical protein  45.1 
 
 
152 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273509  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1441  protein of unknown function DUF1499  33.68 
 
 
158 aa  43.5  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0342472  normal  0.0503993 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1951  hypothetical protein  43.14 
 
 
60 aa  42.7  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>