43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3023 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  500  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  95.37 
 
 		 259 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  95.37 
 
 		 259 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  68.34 
 
 		 262 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  64.86 
 
 		 259 aa  285  8e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  63.32 
 
 		 259 aa  271  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  36.44 
 
 		 284 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  36.65 
 
 		 280 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  40.47 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  38.33 
 
 		 308 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  36.8 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  37.45 
 
 		 259 aa  152  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  37.45 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  46.96 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  37.4 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  39.44 
 
 		 317 aa  126  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  37.38 
 
 		 249 aa  116  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  34.47 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  31.4 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  32.03 
 
 		 261 aa  89  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  33.76 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  35.62 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  34.39 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  27.12 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  31.45 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  33.77 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  35.1 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  27.42 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  30.51 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  38.55 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  26.29 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  35.71 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  30.32 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1126  hypothetical protein  26.88 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  33.56 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0551  hypothetical protein  23.61 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  26.6 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0667  hypothetical protein  27.24 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634534  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0722  hypothetical protein  27.49 
 
 		 317 aa  52  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.405276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  29.13 
 
 		 231 aa  52.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  30.58 
 
 		 965 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1805  hypothetical protein  32.31 
 
 		 152 aa  45.4  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273509  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1951  hypothetical protein  38 
 
 		 60 aa  43.5  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>