44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4295 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  69.47 
 
 		 284 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  71.73 
 
 		 297 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  68.55 
 
 		 308 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  68.89 
 
 		 288 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  70.71 
 
 		 281 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  69.73 
 
 		 317 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  41.3 
 
 		 259 aa  185  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  36.65 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  36.44 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  36.44 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  36.33 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  40.23 
 
 		 262 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  35.55 
 
 		 259 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  35.43 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  33.07 
 
 		 264 aa  119  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  39.9 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  33.61 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  36.05 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  36.29 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  37.5 
 
 		 255 aa  102  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  34.41 
 
 		 262 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  35.23 
 
 		 238 aa  99  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  34.72 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  39.58 
 
 		 252 aa  94.7  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  27.73 
 
 		 262 aa  90.1  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  31.51 
 
 		 233 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  29.69 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  29.46 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  24 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  34.23 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  32.07 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1126  hypothetical protein  25.91 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0551  hypothetical protein  26.51 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  29.15 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  34.74 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  25.73 
 
 		 965 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0667  hypothetical protein  26.12 
 
 		 301 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634534  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0722  hypothetical protein  25.08 
 
 		 317 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.405276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1805  hypothetical protein  44.62 
 
 		 152 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273509  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1734  hypothetical protein  29.67 
 
 		 154 aa  47  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.368748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1951  hypothetical protein  43.4 
 
 		 60 aa  43.9  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>