39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5483 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  441  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  34.63 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  37.34 
 
 		 233 aa  98.2  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  34.29 
 
 		 235 aa  92.4  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  36.32 
 
 		 254 aa  92  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  32.43 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  37.18 
 
 		 255 aa  88.6  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  29.39 
 
 		 237 aa  88.6  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  32.21 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  33.94 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  32.3 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  38.65 
 
 		 417 aa  82  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  38.32 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  29.6 
 
 		 280 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  33.74 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  32.68 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  33.18 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  34.64 
 
 		 259 aa  72  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  32.53 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  31.82 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  34.38 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  30.43 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  29.82 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  28.93 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  28.87 
 
 		 259 aa  62  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  27.48 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  28.07 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  29.81 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  29.81 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  31.07 
 
 		 262 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  30.07 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  29.56 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  28.57 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  30.85 
 
 		 262 aa  54.3  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0551  hypothetical protein  27.27 
 
 		 302 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  26.26 
 
 		 965 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1951  hypothetical protein  44.83 
 
 		 60 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1126  hypothetical protein  25.27 
 
 		 299 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4262  hypothetical protein  28.47 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>