46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2245 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  474  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  62.07 
 
 
235 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  50.22 
 
 
238 aa  231  5e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  50.35 
 
 
253 aa  148  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  38.89 
 
 
263 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  36.24 
 
 
255 aa  142  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  37.1 
 
 
233 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  38.89 
 
 
262 aa  134  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  37.88 
 
 
259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  33.94 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  31.36 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  30.77 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  38.26 
 
 
417 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  32.54 
 
 
280 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  38.89 
 
 
247 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  29.58 
 
 
308 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  33.14 
 
 
254 aa  99  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  35.97 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  34.16 
 
 
317 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  29.03 
 
 
297 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  35.37 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  29.91 
 
 
281 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1951  hypothetical protein  74.58 
 
 
60 aa  92  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  24.24 
 
 
259 aa  89.4  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 
965 aa  88.6  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  27.91 
 
 
264 aa  81.6  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  29.88 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  30.7 
 
 
231 aa  78.2  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  30.34 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  27.18 
 
 
259 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  26.8 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  26.8 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  26.91 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  38.38 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  31.13 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  28.57 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  28.12 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0470  protein of unknown function DUF1499  40.28 
 
 
150 aa  48.9  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3821  protein of unknown function DUF1499  33.72 
 
 
170 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3871  protein of unknown function DUF1499  29.1 
 
 
170 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1069  hypothetical protein  35.05 
 
 
133 aa  48.5  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4262  hypothetical protein  30.3 
 
 
191 aa  48.5  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48250  predicted protein  34.48 
 
 
195 aa  45.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2160  hypothetical protein  27.42 
 
 
164 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.030221  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0551  hypothetical protein  24.17 
 
 
302 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0435  protein of unknown function DUF1499  48.94 
 
 
151 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.332035  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>