41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2397 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  830    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  116  7.999999999999999e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  35.84 
 
 		 254 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  39.52 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  37.8 
 
 		 249 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  38.73 
 
 		 253 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  37.75 
 
 		 238 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  36.18 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  37.2 
 
 		 233 aa  103  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  40 
 
 		 259 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  30.31 
 
 		 288 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  31 
 
 		 235 aa  98.2  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  39.31 
 
 		 262 aa  96.3  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  39.19 
 
 		 252 aa  95.5  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  29.69 
 
 		 280 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  28.63 
 
 		 284 aa  94.7  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  31.45 
 
 		 259 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  30.99 
 
 		 264 aa  86.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  28.51 
 
 		 259 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  30.2 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  44.12 
 
 		 138 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  32.53 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  32.53 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  35.11 
 
 		 231 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  28.63 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  34.81 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  35.1 
 
 		 262 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  35.1 
 
 		 965 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  30.43 
 
 		 263 aa  69.3  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  33.77 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  32.78 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  31.36 
 
 		 259 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  31.65 
 
 		 259 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  32.43 
 
 		 247 aa  62.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  31.1 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  29.17 
 
 		 262 aa  53.1  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1951  hypothetical protein  46.15 
 
 		 60 aa  53.1  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12521  hypothetical protein  38.89 
 
 		 137 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.603502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0517  hypothetical protein  38.89 
 
 		 137 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.407544  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1554  hypothetical protein  45.61 
 
 		 148 aa  44.3  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000544123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>