34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1951 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1951  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  74.58 
 
 		 237 aa  90.9  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  59.65 
 
 		 235 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  60.34 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  52.63 
 
 		 263 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  54.72 
 
 		 233 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  50 
 
 		 253 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  50.94 
 
 		 259 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  47.37 
 
 		 255 aa  57  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  49.06 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  46.15 
 
 		 417 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  43.1 
 
 		 254 aa  50.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  40.68 
 
 		 247 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  44.83 
 
 		 231 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  44.44 
 
 		 261 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  44.64 
 
 		 249 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  50.94 
 
 		 138 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  43.1 
 
 		 262 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  45.28 
 
 		 284 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  39.62 
 
 		 288 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  44.83 
 
 		 262 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  43.4 
 
 		 280 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  38 
 
 		 259 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  38 
 
 		 259 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  38 
 
 		 259 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  37.25 
 
 		 262 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  43.14 
 
 		 317 aa  41.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  34.55 
 
 		 259 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3821  protein of unknown function DUF1499  35.71 
 
 		 170 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3871  protein of unknown function DUF1499  35.71 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  40.82 
 
 		 263 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  44.9 
 
 		 252 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  39.62 
 
 		 259 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  32.73 
 
 		 259 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>