43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1167 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1167  CBS  100 
 
 		 233 aa  465  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  39.73 
 
 		 249 aa  141  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  39.21 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  35 
 
 		 237 aa  132  6e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  35.71 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  37.92 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  37.61 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  40.52 
 
 		 252 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  43.33 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  39.1 
 
 		 238 aa  115  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  42 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  32.66 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  33.02 
 
 		 288 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  30.19 
 
 		 264 aa  95.5  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  41.43 
 
 		 417 aa  94.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  33.5 
 
 		 254 aa  93.6  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  36.24 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  31.87 
 
 		 259 aa  89  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  33.56 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  32.78 
 
 		 259 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  32.89 
 
 		 259 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  32.89 
 
 		 259 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  32.02 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  28.95 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  29.09 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  40.19 
 
 		 138 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  34.25 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  33.05 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  31.51 
 
 		 280 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  29.44 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  29.78 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  26.77 
 
 		 965 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  26.45 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  32.52 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  31.72 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  29.79 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1951  hypothetical protein  54.72 
 
 		 60 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  30.56 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1554  hypothetical protein  46.94 
 
 		 148 aa  42.7  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000544123 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2160  hypothetical protein  32.67 
 
 		 164 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.030221  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3821  protein of unknown function DUF1499  28.97 
 
 		 170 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3871  protein of unknown function DUF1499  28.97 
 
 		 170 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0389  protein of unknown function DUF1499  34.44 
 
 		 139 aa  42  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>