44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2539 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  37.2 
 
 
263 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  34.93 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  34.29 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  33.48 
 
 
238 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  33.8 
 
 
249 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  42.76 
 
 
417 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  31.25 
 
 
235 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  32.26 
 
 
259 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  41.67 
 
 
252 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  32.26 
 
 
262 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  33.14 
 
 
237 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  35.14 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  33.5 
 
 
233 aa  93.6  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  36.16 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  28.57 
 
 
263 aa  89.4  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  29.55 
 
 
259 aa  89  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  29.55 
 
 
259 aa  89  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  33.75 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  34.01 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  35.06 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  34.44 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  28.7 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  34.97 
 
 
281 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  38.38 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  35.59 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  29.46 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  33.49 
 
 
231 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  32.78 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  32.89 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  31.1 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  29.87 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  30.38 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  30.61 
 
 
247 aa  62  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  23.53 
 
 
965 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  29.05 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  29.78 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1951  hypothetical protein  43.1 
 
 
60 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1441  protein of unknown function DUF1499  40.3 
 
 
158 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0342472  normal  0.0503993 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1069  hypothetical protein  35.8 
 
 
133 aa  43.1  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1153  protein of unknown function DUF1499  31.51 
 
 
131 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0967  hypothetical protein  28.33 
 
 
135 aa  42  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.25487  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4262  hypothetical protein  27.55 
 
 
191 aa  42  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2160  hypothetical protein  38.1 
 
 
164 aa  42  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.030221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>