43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4936 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  80.94 
 
 		 297 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  76.43 
 
 		 308 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  70.71 
 
 		 280 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  66.55 
 
 		 284 aa  380  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  65.16 
 
 		 288 aa  371  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  66.67 
 
 		 317 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  38.06 
 
 		 259 aa  169  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  37.05 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  37.4 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  37.4 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  34.27 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  35.04 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  37.15 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  32.43 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  34.13 
 
 		 257 aa  109  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  31.96 
 
 		 235 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  36.13 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  31.58 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  37.31 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  34.55 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  31.69 
 
 		 237 aa  99  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  33.64 
 
 		 249 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  33.63 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  33.04 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  35.26 
 
 		 238 aa  94.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  36.81 
 
 		 252 aa  92.8  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  29.27 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  27.45 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  34.38 
 
 		 417 aa  76.3  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  28.51 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  31.52 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  31.72 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1126  hypothetical protein  26.64 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0551  hypothetical protein  26.71 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0667  hypothetical protein  28.42 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634534  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  30.08 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0722  hypothetical protein  26.8 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.405276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  29.77 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  25.52 
 
 		 965 aa  53.9  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  28.26 
 
 		 231 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1805  hypothetical protein  44.44 
 
 		 152 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273509  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0558  hypothetical protein  25.48 
 
 		 160 aa  43.9  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>