29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0667 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0667  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634534  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0722  hypothetical protein  86.8 
 
 
317 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.405276  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0551  hypothetical protein  47.88 
 
 
302 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1126  hypothetical protein  45.45 
 
 
299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  33.22 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  31.65 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  28.86 
 
 
261 aa  95.5  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  24.42 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  25.08 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  26.12 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  28.42 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  23 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  27.06 
 
 
249 aa  63.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  27.55 
 
 
259 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  27.15 
 
 
259 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  27.15 
 
 
259 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  30.24 
 
 
259 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  24.4 
 
 
308 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  24.58 
 
 
259 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  24.4 
 
 
297 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  24.03 
 
 
259 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  23.32 
 
 
238 aa  52.8  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  26.04 
 
 
317 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  24.03 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  21.98 
 
 
233 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  23.11 
 
 
255 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  22 
 
 
264 aa  44.3  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  26.13 
 
 
262 aa  43.9  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  36.67 
 
 
257 aa  43.5  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>