43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4393 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  100 
 
 		 259 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  84.94 
 
 		 259 aa  388  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  64.86 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  64.86 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  63.32 
 
 		 259 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  66.41 
 
 		 262 aa  285  7e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  48.8 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  39.84 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  37.21 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  36.55 
 
 		 284 aa  156  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  38.25 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  37.07 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  38.43 
 
 		 297 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  40.61 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  36.22 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  39.11 
 
 		 317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  35.24 
 
 		 249 aa  116  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  31.8 
 
 		 233 aa  99  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  32.94 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  34.76 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  33.19 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  33.33 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  30.43 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1126  hypothetical protein  29.55 
 
 		 299 aa  88.6  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  35.47 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0551  hypothetical protein  28.81 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  29.63 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  28.11 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  33.54 
 
 		 263 aa  74.7  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  30.18 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  32.89 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  29.53 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  33.95 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  31.52 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  38.41 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  32.65 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  34.29 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  29.95 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 		 965 aa  52.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1805  hypothetical protein  35.38 
 
 		 152 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273509  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0667  hypothetical protein  23.3 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634534  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0722  hypothetical protein  35.82 
 
 		 317 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.405276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1951  hypothetical protein  34.55 
 
 		 60 aa  42  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>