45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0388 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0388  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  474  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.441494  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  62.07 
 
 		 237 aa  293  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  55.74 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0380  hypothetical protein  42.79 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000064309  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  38.18 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1167  CBS  39.21 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233095  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  38.21 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  38.68 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  37.5 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  35.68 
 
 		 255 aa  129  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0755  hypothetical protein  35.16 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  35.43 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0614  hypothetical protein  39.24 
 
 		 317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  30.43 
 
 		 259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2453  hypothetical protein  30.54 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  32.88 
 
 		 308 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2539  hypothetical protein  31.25 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  31.96 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  36.99 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  30 
 
 		 297 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0774  hypothetical protein  34.44 
 
 		 261 aa  95.1  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2248  hypothetical protein  27.98 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.251746  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2397  hypothetical protein  37.41 
 
 		 417 aa  92.4  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0691  hypothetical protein  29.38 
 
 		 262 aa  89  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  27.41 
 
 		 965 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0858  hypothetical protein  28.57 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0504  hypothetical protein  27.33 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  37.37 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5483  hypothetical protein  32.57 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.747945 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3023  hypothetical protein  25.85 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0975095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1951  hypothetical protein  59.65 
 
 		 60 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2900  hypothetical protein  25.42 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3126  hypothetical protein  25.42 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4393  protein of unknown function DUF1499  28.3 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0949  hypothetical protein  26.98 
 
 		 264 aa  72  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5003  hypothetical protein  31.33 
 
 		 262 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0970477  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2732  hypothetical protein  27.54 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1126  hypothetical protein  22.58 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0667  hypothetical protein  21.8 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.634534  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0551  hypothetical protein  22.02 
 
 		 302 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.845548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1085  protein of unknown function DUF1499  25.85 
 
 		 257 aa  49.7  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3821  protein of unknown function DUF1499  28.38 
 
 		 170 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3871  protein of unknown function DUF1499  28.38 
 
 		 170 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0722  hypothetical protein  22.17 
 
 		 317 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.405276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4262  hypothetical protein  28.71 
 
 		 191 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>