35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48250 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_48250  predicted protein  100 
 
 
195 aa  398  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47157  predicted protein  32.35 
 
 
278 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3821  protein of unknown function DUF1499  40.58 
 
 
170 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1318  hypothetical protein  29.87 
 
 
163 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000275052  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3871  protein of unknown function DUF1499  46.94 
 
 
170 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0389  protein of unknown function DUF1499  30.72 
 
 
139 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00924  hypothetical protein  36.92 
 
 
142 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3619  hypothetical protein  29.1 
 
 
149 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0976  hypothetical protein  34.48 
 
 
133 aa  49.3  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1798  hypothetical protein  53.19 
 
 
147 aa  48.9  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.0185679 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2564  putative lipoprotein  54.17 
 
 
143 aa  47.8  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10341  hypothetical protein  58.14 
 
 
132 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1824  hypothetical protein  47.27 
 
 
175 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123685  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004470  hypothetical protein  47.62 
 
 
119 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2245  hypothetical protein  34.48 
 
 
237 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.241128 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1223  protein of unknown function DUF1499  34.09 
 
 
166 aa  45.8  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11181  hypothetical protein  46.51 
 
 
127 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1492  protein of unknown function DUF1499  44.68 
 
 
175 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269175 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1956  hypothetical protein  51.06 
 
 
144 aa  45.1  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11261  hypothetical protein  44.19 
 
 
127 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11261  hypothetical protein  44.19 
 
 
135 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0466258  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0967  hypothetical protein  50 
 
 
135 aa  45.1  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.25487  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1441  protein of unknown function DUF1499  32.46 
 
 
158 aa  44.7  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0342472  normal  0.0503993 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1038  hypothetical protein  44.19 
 
 
127 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.56394  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0470  protein of unknown function DUF1499  56.76 
 
 
150 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1069  hypothetical protein  52.27 
 
 
133 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1955  hypothetical protein  39.06 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1554  hypothetical protein  32.31 
 
 
148 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000544123 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2228  hypothetical protein  34.12 
 
 
263 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.414181  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3393  hypothetical protein  28.68 
 
 
151 aa  42.4  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000893397  normal  0.318269 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2542  hypothetical protein  48.72 
 
 
146 aa  42.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.322137  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  30.4 
 
 
138 aa  41.6  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0429  hypothetical protein  40.91 
 
 
159 aa  41.6  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0435  protein of unknown function DUF1499  30 
 
 
151 aa  41.2  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.332035  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_7768  predicted protein  38.89 
 
 
139 aa  41.2  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>