51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1038 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1038  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  256  8e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.56394  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11261  hypothetical protein  92.91 
 
 
127 aa  217  5e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11261  hypothetical protein  92.91 
 
 
135 aa  217  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0466258  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11181  hypothetical protein  72.44 
 
 
127 aa  201  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12521  hypothetical protein  44.17 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.603502  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0517  hypothetical protein  44.17 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.407544  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0967  hypothetical protein  45.54 
 
 
135 aa  95.9  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.25487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1069  hypothetical protein  35.88 
 
 
133 aa  88.2  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10341  hypothetical protein  37.27 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1824  hypothetical protein  47.3 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123685  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02001  hypothetical protein  34 
 
 
108 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14141  hypothetical protein  32.03 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0179828 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2542  hypothetical protein  31.82 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.322137  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11671  hypothetical protein  34.26 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1318  hypothetical protein  29.85 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000275052  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2564  putative lipoprotein  36.7 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1492  protein of unknown function DUF1499  46.03 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269175 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004470  hypothetical protein  40.19 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3619  hypothetical protein  31.62 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00924  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1554  hypothetical protein  31.09 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000544123 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0497  hypothetical protein  36 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.223469  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12241  hypothetical protein  36 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3871  protein of unknown function DUF1499  32.88 
 
 
170 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0976  hypothetical protein  36.49 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3821  protein of unknown function DUF1499  32.88 
 
 
170 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0429  hypothetical protein  30.15 
 
 
159 aa  62  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1956  hypothetical protein  34.58 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08691  hypothetical protein  34.95 
 
 
117 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1955  hypothetical protein  32.53 
 
 
162 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07711  hypothetical protein  34.95 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.10668  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0389  protein of unknown function DUF1499  32.35 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0714  hypothetical protein  34.95 
 
 
117 aa  60.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.528598  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07691  hypothetical protein  34.95 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3079  protein of unknown function DUF1499  36.71 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.13205  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3041  protein of unknown function DUF1499  35.44 
 
 
168 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1798  hypothetical protein  29.51 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.0185679 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1441  protein of unknown function DUF1499  34.57 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0342472  normal  0.0503993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3393  hypothetical protein  30.09 
 
 
151 aa  50.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000893397  normal  0.318269 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1223  protein of unknown function DUF1499  37.1 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0470  protein of unknown function DUF1499  32.31 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2319  hypothetical protein  26.27 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150637  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1054  protein of unknown function DUF1499  29.85 
 
 
175 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48250  predicted protein  44.19 
 
 
195 aa  43.9  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0483  hypothetical protein  41.51 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  40.74 
 
 
259 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  40.74 
 
 
262 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0800  hypothetical protein  37.88 
 
 
249 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.376791  normal  0.485007 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0435  protein of unknown function DUF1499  33.93 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.332035  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0664  hypothetical protein  34.62 
 
 
168 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_7768  predicted protein  39.68 
 
 
139 aa  40  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>