51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0483 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0483  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1223  protein of unknown function DUF1499  56.34 
 
 
166 aa  174  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0435  protein of unknown function DUF1499  53.02 
 
 
151 aa  166  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.332035  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0470  protein of unknown function DUF1499  55.17 
 
 
150 aa  154  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1441  protein of unknown function DUF1499  47.41 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0342472  normal  0.0503993 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1824  hypothetical protein  43.33 
 
 
175 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123685  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0389  protein of unknown function DUF1499  50 
 
 
139 aa  99  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2319  hypothetical protein  42.07 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150637  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3821  protein of unknown function DUF1499  41.74 
 
 
170 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3871  protein of unknown function DUF1499  41.74 
 
 
170 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2542  hypothetical protein  38.1 
 
 
146 aa  94  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.322137  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1955  hypothetical protein  38.52 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1318  hypothetical protein  39.47 
 
 
163 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000275052  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3619  hypothetical protein  39.32 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1798  hypothetical protein  38.79 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.0185679 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1492  protein of unknown function DUF1499  34.27 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269175 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1554  hypothetical protein  36.36 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000544123 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3393  hypothetical protein  34.96 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000893397  normal  0.318269 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0976  hypothetical protein  35.25 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1054  protein of unknown function DUF1499  39.13 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0429  hypothetical protein  36.84 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0664  hypothetical protein  36.75 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2160  hypothetical protein  34 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.030221  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1563  protein of unknown function DUF1499  38.32 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1069  hypothetical protein  38.74 
 
 
133 aa  62.8  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004470  hypothetical protein  32.43 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1956  hypothetical protein  33.96 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00924  hypothetical protein  32.69 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2564  putative lipoprotein  28.35 
 
 
143 aa  53.5  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3079  protein of unknown function DUF1499  30.08 
 
 
168 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.13205  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0967  hypothetical protein  41.67 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.25487  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_7768  predicted protein  31.88 
 
 
139 aa  52  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3041  protein of unknown function DUF1499  29.27 
 
 
168 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14141  hypothetical protein  36.51 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0179828 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11261  hypothetical protein  41.51 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02001  hypothetical protein  44.64 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11261  hypothetical protein  41.51 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0466258  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1038  hypothetical protein  41.51 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.56394  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10341  hypothetical protein  52.38 
 
 
132 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47157  predicted protein  28.46 
 
 
278 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07711  hypothetical protein  46.94 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.10668  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08691  hypothetical protein  46.94 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07691  hypothetical protein  46.94 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0714  hypothetical protein  46.94 
 
 
117 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.528598  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00180  hypothetical protein  42.19 
 
 
238 aa  41.6  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1445  hypothetical protein  44.68 
 
 
255 aa  40.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.12832  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2148  hypothetical protein  41.67 
 
 
259 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2472  hypothetical protein  26.67 
 
 
259 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0130018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3697  hypothetical protein  34.33 
 
 
252 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48250  predicted protein  50 
 
 
195 aa  40  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2072  hypothetical protein  46.81 
 
 
262 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>