34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1563 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1563  protein of unknown function DUF1499  100 
 
 
142 aa  290  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2319  hypothetical protein  58.93 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150637  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3821  protein of unknown function DUF1499  42.2 
 
 
170 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1824  hypothetical protein  39.82 
 
 
175 aa  93.6  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123685  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1054  protein of unknown function DUF1499  42.98 
 
 
175 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3871  protein of unknown function DUF1499  41.28 
 
 
170 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1492  protein of unknown function DUF1499  47.27 
 
 
175 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269175 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0435  protein of unknown function DUF1499  40.35 
 
 
151 aa  92  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.332035  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1223  protein of unknown function DUF1499  41.96 
 
 
166 aa  91.3  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2542  hypothetical protein  43.1 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.322137  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0976  hypothetical protein  38.02 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3619  hypothetical protein  38.66 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0470  protein of unknown function DUF1499  40.35 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1554  hypothetical protein  36.67 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000544123 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1318  hypothetical protein  43.24 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000275052  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0483  hypothetical protein  38.32 
 
 
148 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3393  hypothetical protein  33.04 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000893397  normal  0.318269 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0389  protein of unknown function DUF1499  37.3 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2160  hypothetical protein  35.29 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.030221  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0429  hypothetical protein  36.43 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1798  hypothetical protein  35.65 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.0185679 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1441  protein of unknown function DUF1499  39.62 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0342472  normal  0.0503993 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1955  hypothetical protein  35.77 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3079  protein of unknown function DUF1499  36.23 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.13205  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3041  protein of unknown function DUF1499  36.23 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0664  hypothetical protein  32.76 
 
 
168 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1956  hypothetical protein  31.67 
 
 
144 aa  53.9  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004470  hypothetical protein  33.63 
 
 
119 aa  51.6  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2564  putative lipoprotein  29.25 
 
 
143 aa  50.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00924  hypothetical protein  25 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_7768  predicted protein  25.4 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1069  hypothetical protein  28.7 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47157  predicted protein  28.91 
 
 
278 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0967  hypothetical protein  28.32 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.25487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>