43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_12241 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0497  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  226  7e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.223469  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12241  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  226  7e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08691  hypothetical protein  54.31 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0714  hypothetical protein  52.99 
 
 
117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.528598  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07711  hypothetical protein  52.59 
 
 
130 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.10668  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07691  hypothetical protein  52.14 
 
 
117 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277619  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02001  hypothetical protein  53.7 
 
 
108 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11671  hypothetical protein  46.09 
 
 
119 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10341  hypothetical protein  51.46 
 
 
132 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14141  hypothetical protein  38.71 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0179828 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1318  hypothetical protein  35.65 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000275052  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11261  hypothetical protein  37.5 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1038  hypothetical protein  36.46 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.56394  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11261  hypothetical protein  36.46 
 
 
135 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0466258  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0967  hypothetical protein  34.69 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.25487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1069  hypothetical protein  34.29 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0429  hypothetical protein  39.53 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1824  hypothetical protein  33.9 
 
 
175 aa  58.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123685  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1798  hypothetical protein  30.25 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.0185679 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1554  hypothetical protein  30.58 
 
 
148 aa  57.4  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000544123 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1956  hypothetical protein  34.31 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11181  hypothetical protein  33 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0517  hypothetical protein  31.25 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.407544  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00924  hypothetical protein  35.96 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0976  hypothetical protein  32.46 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12521  hypothetical protein  31.25 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.603502  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004470  hypothetical protein  32.08 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2564  putative lipoprotein  39.44 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1441  protein of unknown function DUF1499  32.74 
 
 
158 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0342472  normal  0.0503993 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1492  protein of unknown function DUF1499  32.46 
 
 
175 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269175 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2542  hypothetical protein  31.37 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.322137  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0389  protein of unknown function DUF1499  33.33 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3079  protein of unknown function DUF1499  30.25 
 
 
168 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.13205  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1955  hypothetical protein  30.49 
 
 
162 aa  47.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1266  hypothetical protein  38.1 
 
 
297 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3041  protein of unknown function DUF1499  29.41 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3619  hypothetical protein  27.68 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1164  hypothetical protein  35.82 
 
 
308 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0488894  normal  0.160147 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1734  hypothetical protein  32.95 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.368748  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2319  hypothetical protein  29.31 
 
 
151 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150637  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1677  protein of unknown function DUF1499  36.67 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4295  hypothetical protein  40.35 
 
 
280 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28527  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4936  hypothetical protein  34.38 
 
 
281 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0226323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>