16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0648 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0648  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  287  3e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0632  hypothetical protein  97.84 
 
 
139 aa  281  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3821  protein of unknown function DUF1499  29.03 
 
 
170 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3871  protein of unknown function DUF1499  29.68 
 
 
170 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1824  hypothetical protein  34.31 
 
 
175 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123685  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1554  hypothetical protein  31.15 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000544123 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00924  hypothetical protein  33.01 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2564  putative lipoprotein  31.73 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241443  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004470  hypothetical protein  34.65 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3393  hypothetical protein  29.33 
 
 
151 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000893397  normal  0.318269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2160  hypothetical protein  31.63 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.030221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2319  hypothetical protein  29.17 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.150637  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0389  protein of unknown function DUF1499  33.93 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0976  hypothetical protein  31.73 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1798  hypothetical protein  31.07 
 
 
147 aa  41.2  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.0185679 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0664  hypothetical protein  28.81 
 
 
168 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>