More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3724 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3724  Cysteine desulfurase  100 
 
 		 384 aa  749    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252129  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  43.49 
 
 		 401 aa  312  6.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  42.64 
 
 		 401 aa  311  2e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  43.75 
 
 		 401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  42.75 
 
 		 397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  42.64 
 
 		 398 aa  306  3e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  41.86 
 
 		 398 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  44.9 
 
 		 409 aa  305  8.000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  43.19 
 
 		 394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  41.1 
 
 		 392 aa  300  2e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  42.86 
 
 		 402 aa  299  7e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  40.31 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  45.14 
 
 		 388 aa  296  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  46.43 
 
 		 395 aa  295  9e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  40.42 
 
 		 384 aa  292  7e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  40 
 
 		 384 aa  291  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  39.43 
 
 		 392 aa  291  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  42.89 
 
 		 398 aa  285  7e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  39.79 
 
 		 394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  42.04 
 
 		 394 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  43.38 
 
 		 392 aa  282  6.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  39.95 
 
 		 400 aa  280  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  40.36 
 
 		 414 aa  279  6e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  41.19 
 
 		 381 aa  276  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  40 
 
 		 398 aa  276  5e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1353  aminotransferase, class V  44.76 
 
 		 389 aa  275  8e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  40.79 
 
 		 396 aa  273  3e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  41.9 
 
 		 386 aa  273  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  42.05 
 
 		 388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  39.53 
 
 		 396 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  43.04 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  39.01 
 
 		 398 aa  271  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  40.73 
 
 		 404 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  41.99 
 
 		 382 aa  271  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  39.95 
 
 		 394 aa  269  7e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.25 
 
 		 396 aa  268  8e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  44.16 
 
 		 383 aa  268  8e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  45.03 
 
 		 373 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  42.67 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  40.94 
 
 		 379 aa  268  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  39.95 
 
 		 396 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  42.64 
 
 		 385 aa  265  7e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  39.13 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  39.57 
 
 		 381 aa  263  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  37.89 
 
 		 393 aa  262  8e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  39.13 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  39.3 
 
 		 381 aa  260  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  39.57 
 
 		 381 aa  259  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  39.4 
 
 		 381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  38.86 
 
 		 381 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  39.13 
 
 		 381 aa  259  8e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  39.13 
 
 		 381 aa  259  8e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  39.13 
 
 		 381 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  41.36 
 
 		 399 aa  258  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  40.11 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.11 
 
 		 400 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  38.12 
 
 		 389 aa  257  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1297  aminotransferase class V  39.38 
 
 		 403 aa  257  3e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.216598  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0188  aminotransferase class V  43.35 
 
 		 382 aa  256  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.431625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  43.21 
 
 		 1143 aa  256  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  44.97 
 
 		 383 aa  256  6e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  39.37 
 
 		 399 aa  256  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  36.91 
 
 		 404 aa  255  8e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  41.05 
 
 		 390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  44.21 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  39.01 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  44.07 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  40.68 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  39.09 
 
 		 400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  37.89 
 
 		 401 aa  252  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  37.89 
 
 		 401 aa  252  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  39.16 
 
 		 389 aa  252  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  41.82 
 
 		 422 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  36.84 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  42.78 
 
 		 385 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0403  aminotransferase class V  42.78 
 
 		 378 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  40.26 
 
 		 400 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  39.69 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  36.58 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2547  Cysteine desulfurase  45.5 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  35.22 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  39.79 
 
 		 380 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1215  aminotransferase class V  43.96 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.727858  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  41.94 
 
 		 379 aa  250  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1175  aminotransferase class V  44.47 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  43.44 
 
 		 399 aa  249  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  44.74 
 
 		 381 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  42.64 
 
 		 412 aa  249  5e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  39.16 
 
 		 389 aa  248  9e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  37.34 
 
 		 398 aa  248  9e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  40.36 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  40.36 
 
 		 402 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1098  aminotransferase class V  44.36 
 
 		 379 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.67 
 
 		 389 aa  247  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  38.18 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  38.74 
 
 		 401 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  35.26 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  35.34 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  38.9 
 
 		 391 aa  246  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  44.68 
 
 		 1135 aa  246  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>