More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2547 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2547  Cysteine desulfurase  100 
 
 		 384 aa  761    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  43.26 
 
 		 382 aa  300  2e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  42.86 
 
 		 388 aa  291  9e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  37.47 
 
 		 383 aa  290  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  41.64 
 
 		 394 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  39.26 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  43.01 
 
 		 392 aa  282  6.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  39.36 
 
 		 381 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  40.58 
 
 		 404 aa  282  9e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  39.42 
 
 		 414 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  43.99 
 
 		 382 aa  279  6e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  38.96 
 
 		 381 aa  279  7e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  40.37 
 
 		 384 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  39.79 
 
 		 398 aa  278  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  37.63 
 
 		 382 aa  278  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  39.84 
 
 		 384 aa  277  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  40 
 
 		 402 aa  275  8e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  38.79 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  38.83 
 
 		 381 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  40.94 
 
 		 380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  37.23 
 
 		 381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  37.77 
 
 		 381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  42.78 
 
 		 400 aa  270  4e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  38.16 
 
 		 400 aa  270  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  37.23 
 
 		 381 aa  269  5e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  37.5 
 
 		 381 aa  269  7e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  37.5 
 
 		 381 aa  268  8e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  37.5 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  39.48 
 
 		 398 aa  268  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  38.68 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  36.97 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  42.97 
 
 		 383 aa  266  5.999999999999999e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  37.23 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1684  aminotransferase class V  36.25 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  37.23 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  38.64 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  37.23 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  43.35 
 
 		 383 aa  263  3e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  39.26 
 
 		 394 aa  263  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.05 
 
 		 400 aa  263  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  40.74 
 
 		 380 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  40.69 
 
 		 388 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  39.79 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2302  aminotransferase class V  35.42 
 
 		 395 aa  261  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.729781  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1047  cysteine desulfurase IscS  42.15 
 
 		 411 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  39.52 
 
 		 388 aa  260  2e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  38.2 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  38.79 
 
 		 396 aa  260  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1064  aminotransferase, class V  35.7 
 
 		 387 aa  259  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  38.99 
 
 		 398 aa  259  6e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  36.81 
 
 		 393 aa  259  6e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1273  cysteine desulfhydrase  38.52 
 
 		 380 aa  259  7e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000190468  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1331  aminotransferase, class V  38.52 
 
 		 380 aa  259  7e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957833  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  38.3 
 
 		 402 aa  256  5e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  39.74 
 
 		 436 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  39.74 
 
 		 436 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  39.14 
 
 		 391 aa  255  7e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  37.57 
 
 		 407 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0830  cysteine desulfurase IscS  39.95 
 
 		 407 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.184128 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  37.23 
 
 		 406 aa  255  1.0000000000000001e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0720  Cysteine desulfurase  37.66 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  38.07 
 
 		 389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  39.48 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  41.19 
 
 		 409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  41.29 
 
 		 1143 aa  252  6e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  38.96 
 
 		 403 aa  252  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2719  aminotransferase class V  34.63 
 
 		 380 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2190  Cysteine desulfurase  41.93 
 
 		 406 aa  252  8.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.980213  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34119  precursor of desulfurase cysteine desulfurase IscS  39.2 
 
 		 400 aa  251  1e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  39.12 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  39.12 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  39.12 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1776  cysteine desulfurase  40.3 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.743071  hitchhiker  0.0000439392 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  39.12 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  39.12 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  39.12 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  40.48 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  39.12 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  39.12 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  39.12 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  42.55 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  42.15 
 
 		 388 aa  250  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  37.53 
 
 		 405 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3511  cysteine desulfurase  40 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  39.69 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  37.23 
 
 		 398 aa  249  4e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4612  cysteine desulfurase  40.11 
 
 		 404 aa  250  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0217102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2871  cysteine desulfurase  38.3 
 
 		 404 aa  249  5e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000328828 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.36 
 
 		 404 aa  249  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  38.6 
 
 		 404 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2262  cysteine desulfurase  40.1 
 
 		 406 aa  249  5e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  41.97 
 
 		 1139 aa  249  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  39.89 
 
 		 379 aa  249  6e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  39.57 
 
 		 391 aa  249  6e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  38.66 
 
 		 406 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0673  cysteine desulfurase IscS  39.47 
 
 		 407 aa  249  6e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  39.52 
 
 		 389 aa  249  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0822  cysteine desulfurase IscS  39.47 
 
 		 421 aa  249  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.02372  normal  0.880264 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0097  aminotransferase class V  34.78 
 
 		 377 aa  249  8e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  38.34 
 
 		 404 aa  249  8e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>