More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0214 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0214  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
144 aa  298  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1202  putative PAS/PAC sensor protein  79.02 
 
 
144 aa  244  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3701  putative PAS/PAC sensor protein  76.6 
 
 
145 aa  235  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2658  putative PAS/PAC sensor protein  72.66 
 
 
145 aa  222  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1034  putative PAS/PAC sensor protein  71.11 
 
 
158 aa  210  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0298  putative PAS/PAC sensor protein  60 
 
 
149 aa  179  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.169835  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0466  putative PAS/PAC sensor protein  56.74 
 
 
147 aa  179  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.98341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0483  putative PAS/PAC sensor protein  58.52 
 
 
147 aa  177  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000401014 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3152  sensory box protein  59.56 
 
 
151 aa  174  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3172  putative PAS/PAC sensor protein  59.23 
 
 
151 aa  168  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.920236  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3857  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 
145 aa  154  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.759378  normal  0.914632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5550  putative PAS/PAC sensor protein  52.71 
 
 
141 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1710  putative PAS/PAC sensor protein  47.06 
 
 
144 aa  146  9e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.010044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1781  putative PAS/PAC sensor protein  47.06 
 
 
144 aa  146  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.345246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2168  putative PAS/PAC sensor protein  47.06 
 
 
144 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.242596  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4662  PAS  51.13 
 
 
145 aa  144  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0488  putative PAS/PAC sensor protein  49.28 
 
 
148 aa  143  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2761  putative PAS/PAC sensor protein  47.37 
 
 
143 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0282  transcriptional regulator  48.84 
 
 
141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.283126  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6742  putative PAS/PAC sensor protein  47.37 
 
 
143 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.63921  normal  0.585827 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3616  putative PAS/PAC sensor protein  46.62 
 
 
143 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62766  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2133  putative PAS/PAC sensor protein  54.46 
 
 
141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0362  putative PAS/PAC sensor protein  47.29 
 
 
141 aa  134  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4051  putative PAS/PAC sensor protein  47.73 
 
 
142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4841  putative PAS/PAC sensor protein  46.56 
 
 
143 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1206  PAS sensor protein  46.97 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2802  putative PAS/PAC sensor protein  44.7 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.540476  normal  0.477024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1366  putative PAS/PAC sensor protein  46.21 
 
 
149 aa  128  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5581  putative PAS/PAC sensor protein  44.36 
 
 
157 aa  128  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.595222 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2500  putative PAS/PAC sensor protein  43.28 
 
 
143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1145  putative PAS/PAC sensor protein  43.7 
 
 
149 aa  127  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4485  putative PAS/PAC sensor protein  43.7 
 
 
145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0639  putative PAS/PAC sensor protein  43.94 
 
 
142 aa  119  9e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0993  putative PAS/PAC sensor protein  41.09 
 
 
146 aa  118  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1568  transcriptional regulator  34.68 
 
 
139 aa  96.7  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683844  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3803  PAS  37.3 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051055 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0692  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
620 aa  83.6  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  36.29 
 
 
732 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 
1721 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
1589 aa  79.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 
1088 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
857 aa  76.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0285  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
713 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2007  putative PAS/PAC sensor protein  36.72 
 
 
692 aa  75.5  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259838  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
1374 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.37 
 
 
1348 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1745  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
501 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216394  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
851 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0076  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.79 
 
 
898 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1362  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.77 
 
 
862 aa  72.8  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.525156  hitchhiker  0.0000167572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
484 aa  72.8  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
543 aa  73.2  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0316  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
713 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810499  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 
1158 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
907 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
1085 aa  72.8  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
979 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
705 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2450  PAS sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
499 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
515 aa  70.9  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1533  sensory box protein  30.3 
 
 
965 aa  70.5  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76081  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
439 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.84 
 
 
728 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1608  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32 
 
 
1015 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00363686 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0819  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.87 
 
 
393 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
368 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2366  two component sensor histidine kinase  33.33 
 
 
1154 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0469089  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1538  putative PAS/PAC sensor protein  30.47 
 
 
495 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  30.95 
 
 
823 aa  67.8  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0431  putative PAS/PAC sensor protein  51.72 
 
 
67 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00281975  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1907  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
494 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6199  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.08 
 
 
740 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.5 
 
 
524 aa  67.8  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
490 aa  67.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
1313 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1877  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.65 
 
 
722 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2964  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
647 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 
657 aa  67  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
1676 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
1426 aa  67  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0328  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.94 
 
 
951 aa  67  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 
1050 aa  67  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3278  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.75 
 
 
2468 aa  67  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0267066 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
807 aa  67  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1295  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.34 
 
 
568 aa  67  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
455 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4928  sensory box protein  29.92 
 
 
868 aa  65.5  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 
1629 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 
1629 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9007  two component sensor kinase  28.81 
 
 
359 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1191  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.83 
 
 
836 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.668547  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1029  Signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
511 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0828  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.77 
 
 
705 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263072  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
513 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
524 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.85 
 
 
1248 aa  66.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 
1625 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 
739 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0531  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
1193 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  29.55 
 
 
771 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>