More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2761 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2761  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 143 aa  295  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6742  putative PAS/PAC sensor protein  94.41 
 
 		 143 aa  279  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.63921  normal  0.585827 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3616  putative PAS/PAC sensor protein  79.02 
 
 		 143 aa  248  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4662  PAS  72.66 
 
 		 145 aa  222  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2802  putative PAS/PAC sensor protein  70.42 
 
 		 152 aa  217  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.540476  normal  0.477024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4841  putative PAS/PAC sensor protein  64.29 
 
 		 143 aa  200  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4485  putative PAS/PAC sensor protein  64.29 
 
 		 145 aa  200  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1366  putative PAS/PAC sensor protein  67.39 
 
 		 149 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1145  putative PAS/PAC sensor protein  66.67 
 
 		 149 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1206  PAS sensor protein  67.15 
 
 		 149 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.490223  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4051  putative PAS/PAC sensor protein  64.44 
 
 		 142 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.949542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0488  putative PAS/PAC sensor protein  62.94 
 
 		 148 aa  191  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5581  putative PAS/PAC sensor protein  63.04 
 
 		 157 aa  184  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.595222 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2500  putative PAS/PAC sensor protein  60.14 
 
 		 143 aa  177  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0639  putative PAS/PAC sensor protein  54.35 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0993  putative PAS/PAC sensor protein  55.94 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1710  putative PAS/PAC sensor protein  55.56 
 
 		 144 aa  167  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.010044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1781  putative PAS/PAC sensor protein  55.56 
 
 		 144 aa  166  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.345246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2168  putative PAS/PAC sensor protein  54.55 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.242596  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5550  putative PAS/PAC sensor protein  57.72 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3857  putative PAS/PAC sensor protein  52.24 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.759378  normal  0.914632 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0362  putative PAS/PAC sensor protein  53.54 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3701  putative PAS/PAC sensor protein  50.38 
 
 		 145 aa  144  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2658  putative PAS/PAC sensor protein  46.97 
 
 		 145 aa  144  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3152  sensory box protein  46.1 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2133  putative PAS/PAC sensor protein  57.02 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1034  putative PAS/PAC sensor protein  47.2 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0483  putative PAS/PAC sensor protein  47.41 
 
 		 147 aa  141  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000401014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0466  putative PAS/PAC sensor protein  47.41 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.98341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0298  putative PAS/PAC sensor protein  48.06 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.169835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0214  putative PAS/PAC sensor protein  47.37 
 
 		 144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3172  putative PAS/PAC sensor protein  48.82 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.920236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0282  transcriptional regulator  50.39 
 
 		 141 aa  136  8.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.283126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1202  putative PAS/PAC sensor protein  44.53 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1568  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683844  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3803  PAS  37.61 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051055 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  34.4 
 
 		 732 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5232  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 698 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 		 1374 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 1589 aa  77.4  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2366  two component sensor histidine kinase  35.43 
 
 		 1154 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0469089  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2007  putative PAS/PAC sensor protein  38.66 
 
 		 692 aa  76.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.259838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 1721 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1533  sensory box protein  34.35 
 
 		 965 aa  74.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76081  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.84 
 
 		 1248 aa  73.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.12 
 
 		 1313 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 857 aa  72  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1109  putative PAS/PAC sensor protein  29.23 
 
 		 557 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.92 
 
 		 728 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 455 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0692  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 620 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0285  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 713 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  37.89 
 
 		 684 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.4 
 
 		 960 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 573 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000284252 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 		 695 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0677  sensory box/GGDEF family protein  29.2 
 
 		 947 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000825914  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2785  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.27 
 
 		 648 aa  67  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3530  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.03 
 
 		 654 aa  67  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  30.6 
 
 		 1328 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 1171 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  32.52 
 
 		 1969 aa  66.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 398 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827775  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 457 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2315  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.23 
 
 		 458 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1060  Fis family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 486 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0958  Fis family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 486 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1027  Fis family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 486 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3332  sigma54 specific transcriptional regulator with PAS/PAC sensor, Fis family  35.21 
 
 		 486 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0431  putative PAS/PAC sensor protein  49.12 
 
 		 67 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00281975  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 1568 aa  64.7  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.37 
 
 		 881 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 446 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 964 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0076  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.46 
 
 		 898 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 		 948 aa  64.3  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3031  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 807 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.672924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 979 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0316  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 713 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  31.62 
 
 		 509 aa  63.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2825  PAS:GGDEF  33.06 
 
 		 548 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.067576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 851 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1146  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 		 909 aa  63.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6199  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.95 
 
 		 740 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  37.07 
 
 		 853 aa  63.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  30.37 
 
 		 823 aa  63.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0819  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30 
 
 		 393 aa  62  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0634  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 		 1000 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.932649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3227  Fis family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 488 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.539563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 352 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.01 
 
 		 1088 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 705 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2345  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 509 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2228  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 654 aa  61.6  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2470  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.59 
 
 		 693 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000343207  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0887  Fis family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 488 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3135  Fis family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 488 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1325  sensory box protein  28.79 
 
 		 428 aa  61.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2374  putative sensory box-containing diguanylate cyclase  33.59 
 
 		 693 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1658  putative sensory box-containing diguanylate cyclase  33.59 
 
 		 693 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000881395  normal  0.485091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>